[发明专利]一种肽核酸鸟嘌呤单体的合成方法在审

专利信息
申请号: 202011609929.6 申请日: 2020-12-30
公开(公告)号: CN114685606A 公开(公告)日: 2022-07-01
发明(设计)人: 谢同;张建军 申请(专利权)人: 苏州怡彼得生物技术有限公司
主分类号: C07K5/078 分类号: C07K5/078
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 215144 江苏省苏州市苏州相城经济*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 核酸 嘌呤 单体 合成 方法
【说明书】:

发明提供了一种肽核酸鸟嘌呤单体的合成方法,包括如下步骤,1)将2‑N‑(二苯甲氧羰基)鸟嘌呤‑9‑乙酸溶于N,N‑二甲基甲酰胺中,搅拌下加入N‑羟基丁二酰亚胺,0℃下加入1‑(3‑二甲氨基丙基)‑3‑乙基碳二亚胺盐酸盐,在室温下搅拌反应,TLC显示反应完毕;2)将N‑(2‑Fmoc‑氨乙基)甘氨酸溶于N,N‑二甲基甲酰胺中,加入步骤1)得到的活性酯,0℃下滴加N,N‑二异丙基乙胺,室温反应过夜,即得到所需的产物肽核酸鸟嘌呤单体。本发明简化了反应路线,反应条件温和;避免了酰氯的使用,无需无水无氧操作;所用溶剂可以回收再利用,绿色环保;为肽核酸鸟嘌呤单体的产业化提供了基础。

技术领域

本发明属于化学合成技术领域,尤其是涉及一种肽核酸鸟嘌呤单体的合成方法。

背景技术

肽核酸,一类以多肽骨架取代糖磷酸主链的DNA类似物, 是丹麦有机化学家 OleBuchardt和生物化学家 Peter Nielsen 于20 世纪80 年代开始潜心研究的一种新的核酸序列特异性试剂。它是在第一代、第二代反义试剂的基础上 ,通过计算机设计构建并最终人工合成的第三代反义试剂,是一种全新的DNA类似物,即以中性的肽链酰胺2-氨基乙基甘氨酸键取代了DNA中的戊糖磷酸二酯键骨架,其余的与DNA相同,PNA可以通过Watson-Crick碱基配对的形式识别并结合DNA或RNA序列,形成稳定的双螺旋结构。

根据PNA的代谢稳定性,主要将其用于抑制基因表达的反义药物研究领域,国外几家制药及生物技术公司均投入大量精力从事开发研究;根据其与DNA优良的杂交稳定性,PNA又被广泛用于DNA分子识别和操纵。PNA可以广泛用于病原体、遗传病检测的分子杂交、原位杂交、突变分析、抗癌、抗病毒反义核酸研究和应用。尤其是PNA可以取代寡核苷酸用于基因芯片的制备,将比普通基因芯片更稳定,特异性也更好,被认为是基因芯片的升级产品。PNA也可用于定量PCR,可以用于实时检测PCR的扩增反应;也可将其做成PNA Beacon,用于实时监测细胞内的RNA表达。随着PNA基础研究的不断深入和新技术的不断出现,PNA将显示出无比优越的性能和更为广阔的应用前景。

由于 PNA 的特殊化学结构且不带电荷,所以 PNA 探针与目标 DNA 结合的特异性与灵敏性都非常高。因此PNA 作为 FISH probes 非常有效,即使在浓度非常低的情况下也能够有比较明显的效果。PNA Probes 与目标序列的结合非常快 (几个小时内),而且干扰背景少。

目前世界范围内新冠肺炎蔓延,肽核酸探针作为快速诊断试剂必将得到广泛应用。

目前国内没有一家公司能对这个产品进行大规模的产业化,其合成规模一般只达到克级水平,仅适合于研究用,无法提供长期稳定的商品供应。其中合成工艺路线长,操作繁琐,是大规模合成肽核酸鸟嘌呤单体的瓶颈。

现有肽核酸鸟嘌呤单体合成工艺存在着诸多问题,合成路线长,工艺复杂,收率低,操作繁琐;反应中用到无水无氧条件;投料比例难以控制,造成副产物增多。尤其是合成最终产物的步骤,由于两个保护基在反应条件下都有可能脱落,使得反应收率难以把握,其后处理中杂质难以去除。

发明内容

有鉴于此,本发明旨在提出一种肽核酸鸟嘌呤单体的合成方法,以克服现有技术中的不足,避免了无水无氧反应条件的使用,反应条件温和;溶剂可以重复再利用,节约生产成本;工艺路线得到简化;为肽核酸鸟嘌呤单体的合成的产业化提供基础。

为达到上述目的,本发明的技术方案是这样实现的:

一种肽核酸鸟嘌呤单体的合成方法,包括如下步骤,

1)将2-N-(二苯甲氧羰基)鸟嘌呤-9-乙酸溶于N,N-二甲基甲酰胺中,搅拌下加入N-羟基丁二酰亚胺,0℃下加入1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐,在室温下搅拌反应,TLC显示反应完毕;

2)将N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸溶于N,N-二甲基甲酰胺中,加入步骤1)得到的活性酯,0℃下滴加N,N-二异丙基乙胺,室温反应过夜,即得到所需的产物肽核酸鸟嘌呤单体。

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