[发明专利]一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系及构建方法有效
申请号: | 202011611328.9 | 申请日: | 2020-12-30 |
公开(公告)号: | CN112695111B | 公开(公告)日: | 2023-10-03 |
发明(设计)人: | 陈莹;王永;王鑫;汪子轩;史巧珍 | 申请(专利权)人: | 徐州医科大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/06;C12N15/11;C12R1/445;C12R1/145;C12R1/01 |
代理公司: | 北京汇捷知识产权代理事务所(普通合伙) 11531 | 代理人: | 赵艳 |
地址: | 221004 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 多种 性病 pcr 体系 构建 方法 | ||
本发明公开了一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系及构建方法。本发明通过五种菌的单重PCR优化初始检测体系的引物和退火温度,进一步通过三重PCR优化出退火温度为50~59.2℃,通过四重PCR优化出退火温度为58℃和53.8℃,在此范围内通过五重PCR优化出退火温度为54℃,并进一步优化出各菌所用引物的浓度值,最终得到可同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系,该检测体系可进行多种靶基因的并行检测,检测成本低,检测效率大大提高;其中,金黄色葡萄球菌检测限为228pg,单增李斯特菌检测限为365pg,福氏志贺菌检测限为1.9pg,艰难梭菌检测限为223pg,小肠结肠炎耶尔森菌检测限为37.9pg。
技术领域
本发明属于生物医学检测领域,尤其涉及一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系及构建方法。
背景技术
食源性疾病严重危害公共卫生,并在许多国家和地区造成严重的经济损失,因此,建立简单,快速和灵敏的检测方法尤为重要。与食源性相关重要病原菌(如金黄色葡萄球菌、单增李斯特菌、福氏志贺菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、艰难梭菌等),感染率高、传播速度快。其中,志贺菌属(Shigella spp.)是人类重要的肠道传染病病原菌,并影响肠道稳态,由志贺菌感染引起的细菌性痢疾(菌痢),全球每年发病人数达1.647亿;金黄色葡萄球菌是引起人类食物中毒重要病原体,它是自然界中广泛分布的主要医院病原体之一;近年来,耐多药金黄色葡萄球菌的临床分离率一直在上升;小肠结肠炎耶尔森氏菌可引起严重的后遗症,例如结节性红斑和反应性关节炎等,而单增李斯特菌是一种人畜共患病原体,可引起人类和动物李斯特菌病;艰难梭菌是重要的肠道病原菌,且与食源性疾病密切相关,研究表明,该菌可以从肉中分离出来,其与人类食源性疾病的关系越来越密切。
目前临床传统检测上述食源性病原菌繁琐耗时,且准确性和灵敏度仍需提高,而发掘精准有效、简便检测手段,对食源性病原菌进行快速检测和分析,对于临床诊断、食品安全以及流行病学调查中的病原体监测具有重要意义。
发明内容
本发明的首要目的在于提供一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系,旨在解决现有食源性病原菌的检测方法繁琐耗时、准确性和灵敏度不高等问题;
本发明的再一目的在于提供上述PCR检测体系的构建方法。
本发明是这样实现的,一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系,所述食源性病原菌包括金黄色葡萄球菌、单增李斯特菌、福氏志贺菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、艰难梭菌,该PCR检测体系通过PCR引物组对食源性病原菌DNA进行PCR扩增获得检测结果;
所述PCR引物组中各引物分别以金黄色葡萄球菌的nuc基因、单增李斯特菌的hlyA基因、福氏志贺菌的ipaH基因、小肠结肠炎耶尔森氏菌的lysP基因和艰难梭菌的tpi基因为靶标进行设计与合成得到,包括10μmol/L的nuc引物、10μmol/L的hlyA引物、5μmol/L的ipaH引物、3μmol/L的lysP引物和2μmol/L的tpi引物;
反应液配制为:
所述PCR扩增的反应条件为:
预变性:94℃、5min,
变性:94℃、30s,
退火:54℃、30s,
延伸:72℃、30s,
循环数:30,
延伸:72℃、7min。
优选地,所述PCR引物组中,
所述nuc引物为:
nuc引物F:5'-CTTTAGCCAAGCCTTGACGAAC-3',
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