[发明专利]一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系及构建方法有效

专利信息
申请号: 202011611328.9 申请日: 2020-12-30
公开(公告)号: CN112695111B 公开(公告)日: 2023-10-03
发明(设计)人: 陈莹;王永;王鑫;汪子轩;史巧珍 申请(专利权)人: 徐州医科大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/06;C12N15/11;C12R1/445;C12R1/145;C12R1/01
代理公司: 北京汇捷知识产权代理事务所(普通合伙) 11531 代理人: 赵艳
地址: 221004 江苏省*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 同时 检测 多种 性病 pcr 体系 构建 方法
【说明书】:

发明公开了一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系及构建方法。本发明通过五种菌的单重PCR优化初始检测体系的引物和退火温度,进一步通过三重PCR优化出退火温度为50~59.2℃,通过四重PCR优化出退火温度为58℃和53.8℃,在此范围内通过五重PCR优化出退火温度为54℃,并进一步优化出各菌所用引物的浓度值,最终得到可同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系,该检测体系可进行多种靶基因的并行检测,检测成本低,检测效率大大提高;其中,金黄色葡萄球菌检测限为228pg,单增李斯特菌检测限为365pg,福氏志贺菌检测限为1.9pg,艰难梭菌检测限为223pg,小肠结肠炎耶尔森菌检测限为37.9pg。

技术领域

本发明属于生物医学检测领域,尤其涉及一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系及构建方法。

背景技术

食源性疾病严重危害公共卫生,并在许多国家和地区造成严重的经济损失,因此,建立简单,快速和灵敏的检测方法尤为重要。与食源性相关重要病原菌(如金黄色葡萄球菌、单增李斯特菌、福氏志贺菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、艰难梭菌等),感染率高、传播速度快。其中,志贺菌属(Shigella spp.)是人类重要的肠道传染病病原菌,并影响肠道稳态,由志贺菌感染引起的细菌性痢疾(菌痢),全球每年发病人数达1.647亿;金黄色葡萄球菌是引起人类食物中毒重要病原体,它是自然界中广泛分布的主要医院病原体之一;近年来,耐多药金黄色葡萄球菌的临床分离率一直在上升;小肠结肠炎耶尔森氏菌可引起严重的后遗症,例如结节性红斑和反应性关节炎等,而单增李斯特菌是一种人畜共患病原体,可引起人类和动物李斯特菌病;艰难梭菌是重要的肠道病原菌,且与食源性疾病密切相关,研究表明,该菌可以从肉中分离出来,其与人类食源性疾病的关系越来越密切。

目前临床传统检测上述食源性病原菌繁琐耗时,且准确性和灵敏度仍需提高,而发掘精准有效、简便检测手段,对食源性病原菌进行快速检测和分析,对于临床诊断、食品安全以及流行病学调查中的病原体监测具有重要意义。

发明内容

本发明的首要目的在于提供一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系,旨在解决现有食源性病原菌的检测方法繁琐耗时、准确性和灵敏度不高等问题;

本发明的再一目的在于提供上述PCR检测体系的构建方法。

本发明是这样实现的,一种同时检测多种食源性病原菌的PCR检测体系,所述食源性病原菌包括金黄色葡萄球菌、单增李斯特菌、福氏志贺菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、艰难梭菌,该PCR检测体系通过PCR引物组对食源性病原菌DNA进行PCR扩增获得检测结果;

所述PCR引物组中各引物分别以金黄色葡萄球菌的nuc基因、单增李斯特菌的hlyA基因、福氏志贺菌的ipaH基因、小肠结肠炎耶尔森氏菌的lysP基因和艰难梭菌的tpi基因为靶标进行设计与合成得到,包括10μmol/L的nuc引物、10μmol/L的hlyA引物、5μmol/L的ipaH引物、3μmol/L的lysP引物和2μmol/L的tpi引物;

反应液配制为:

所述PCR扩增的反应条件为:

预变性:94℃、5min,

变性:94℃、30s,

退火:54℃、30s,

延伸:72℃、30s,

循环数:30,

延伸:72℃、7min。

优选地,所述PCR引物组中,

所述nuc引物为:

nuc引物F:5'-CTTTAGCCAAGCCTTGACGAAC-3',

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