[发明专利]一种基于二代测序的人类Y-STR检测方法及其应用

说明书

本发明属于法医学应用技术领域，具体涉及一种基于二代测序的人类Y‑STR检测方法及其应用。本发明提供的方法是根据中国人群STR群体遗传多态性分析结果，最终筛选出88个Y染色体基因座，包括88个Y染色体STR基因座，并进一步对其设计引物，经文库构建、纯化、测序及数据分析等完成检测。本发明提供的检测方法具有灵敏性高、测序性能好等优点。

技术领域

本发明属于法医学应用技术领域，具体涉及一种基于二代测序的人类Y-STR检测方法及其应用。

背景技术

人类Y染色体短串联重复(Y-STR)具有父系遗传、缺乏重组、分型简单、信息量大、多态性高等特点，是研究人类的起源进化、民族差异、种族差异、群体及地区分布等的有力工具。目前应用Y-STR的家系排查已成为刑事侦查的重要途径，能够有效减少刑事办案中摸底排查的工作。但由于目前商品化的试剂盒，Y-STR位点数目不足，实际返回结果的个体数过多，无法有效减少刑事侦查的工作量。

目前，荧光标记多重扩增结合毛细管电泳(PCR-CE)是STR分型的主流技术。但是基于PCR-CE分型时，相同片段长度的等位基因中存在重复区域序列结构不一致的情况。另外PCR-CE技术分型多拷贝Y-STR仅能检测长度多态性。

二代测序技术(NGS)，具有测序通量高、速度快的优点。NGS不仅能从长度多态性上对STR基因座进行分析，可以检测多拷贝Y-STR基因座的序列信息，具有更高的基因多样性及个体识别力。目前，针对二代测序商业化Y-STR分型试剂盒的研发尚处于起步阶段，主要有Y23 System(Promega)、ForenSeqTM DNA Signature Prep Kit(Illumina)、Yfiler^TMPlus PCR Amplification Kit(Thermol Fisher)和GlobalFiler PCRAmplification Kit(Thermol Fisher)。但以上试剂盒涉及的Y-STR相对较少，四个试剂盒分别包含了23个Y-STR基因座、24个Y-STR基因座、27个Y-STR基因座和2个Y-STR基因座。同时存在试剂盒价格昂贵，配套的数据分析软件只能针对各自开发试剂盒，参数的设置相对固定，只能对固有基因座的测序数据进行分析，不利于法医学实际应用。

发明内容

针对现有技术中普遍存在的缺陷，本发明创造性的提供了一种基于二代测序的人类Y-STR检测方法。本发明提供的方法，准确度高、灵敏性好，有较好的测序性能，可应用于法医领域的研究。

为了达到上述目的，本发明采用的技术方案为：

一种基于二代测序的人类Y-STR检测方法，包括如下步骤：

S1、根据中国人群STR群体遗传多态性分析结果，最终筛选获得88个Y染色体基因座，分别为DYS19、DYF371a/b/c/d、DYS385a/b、DYF387S1a/b、DYS388、DYS389-I、DYS389-II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYF397S1a/b、DYF399S1a/b/c、DYF403S1a1/a2/b1/b2、DYF404S1a/b、DYS425a/b/c/d、DYS437、DYS438、DYS439、DYS443、DYS444、DYS446、DYS447、DYS448、DYS449、DYS456、DYS458、DYS459a/b、DYS460、DYS464a/b/c/d、DYS481、DYS485、DYS504、DYS505、DYS508、DYS510、DYS518、DYS520、DYS522、DYS526a/b、DYS527a/b、DYS531、DYS533、DYS549、DYS552、DYS557、DYS570、DYS576、DYS587、DYS593、DYS596、DYS612、DYS617、DYS622、DYS626、DYS627、DYS630、DYS635、DYS641、DYS643、DYS644、DYS645、DYS710、DYS720、DYS722、Y-GATA-A10、Y-GATA-H4；