[发明专利]用于确定受试者的妊娠相关状态的方法和系统

说明书

本申请提供了针对妊娠相关状态的无细胞鉴定和/或监测的方法和系统。用于鉴定或监测受试者的妊娠相关状态的存在或敏感性的方法可以包括测定源自所述受试者的无细胞生物样品以检测生物标志物组，并且使用经训练的算法分析生物标志物组以确定妊娠相关状态的存在或敏感性。

交叉引用

本申请要求于2019年2月14日提交的美国专利申请号62/805,515、于2019年8月22日提交的美国专利申请号62/890,248和于2019年10月28日提交的美国专利申请号62/926,786的权益，其各自通过引用以其全文并入本文。

背景技术

每年，全球报告有约1500万例早产。早产可影响多达约10％的妊娠，其中大多数是自然早产。目前，可能尚无有意义的、临床上可操作的可用于许多妊娠相关的并发症，例如早产的诊断筛查或检验。然而，妊娠相关的并发症(例如早产)是新生儿死亡和晚年并发症的主要原因。此外，此类妊娠相关的并发症可对母体健康造成负面影响。因此，为了使妊娠尽可能安全，需要快速、准确的方法以鉴定和监测妊娠相关状态，这些方法是非侵入性且具有成本效益的，以改善母体和胎儿的健康。

发明内容

本申请提供了通过处理获自或源自受试者的无细胞生物样品以鉴定或监测妊娠相关状态的方法、系统和试剂盒。可以对获自受试者的无细胞生物样品(例如，血浆样品)进行分析以鉴定妊娠相关状态(可以包括，例如，测量妊娠相关状态的存在、不存在或相对评估)。此类受试者可以包括具有一种或多种妊娠相关状态的受试者和没有妊娠相关状态的受试者。妊娠相关状态可以包括，例如，早产、足月产、胎龄、预产期(例如，受试者的未出生婴儿或胎儿的预产期)、分娩开始、妊娠相关高血压症(例如，子痫前期)、子痫、妊娠糖尿病、受试者胎儿的先天性疾病、异位妊娠、自然流产、死产、产后并发症(例如，产后抑郁症、出血或失血过多、肺栓塞、心肌病、糖尿病、贫血和高血压症)、妊娠剧吐(晨吐)、分娩时出血或失血过多、胎膜早破、早产胎膜早破、前置胎盘(胎盘覆盖子宫颈)、宫内/胎儿生长受限、巨大胎儿(对于胎龄来说的大胎儿)、新生儿状况(例如，贫血、呼吸暂停、心动过缓和其他心脏缺陷、支气管肺发育不良或慢性肺病、糖尿病、腹裂、脑积水、高胆红素血症、低钙血症、低血糖、脑室内出血、黄疸、坏死性小肠结肠炎、动脉导管未闭、脑室周围白质软化、持续性肺动脉高压、红细胞增多症、呼吸窘迫综合征、早产儿视网膜病变和短暂性呼吸急促)、以及胎儿发育阶段或状态(例如，胎儿器官功能或发育正常，和胎儿器官功能或发育异常)。

一方面，本申请提供了一种用于鉴定受试者的妊娠相关状态的存在(presence)或敏感性(susceptibility)的方法，包括测定源自受试者的无细胞生物样品中的转录物和/或代谢物以检测生物标志物组，并且使用经训练的算法分析生物标志物组以确定妊娠相关状态的存在或敏感性。在一些实施方案中，所述方法包括测定源自受试者的无细胞生物样品中的转录物以检测生物标志物组。在一些实施方案中，转录物使用核酸测序进行测定。在一些实施方案中，所述方法包括测定源自受试者的无细胞生物样品中的代谢物以检测生物标志物组。在一些实施方案中，代谢物使用代谢组学测定进行测定。