[发明专利]用于生物流体的蛋白质冕分析的组合物、方法和系统及其用途

权利要求书

1.一种串行探询样品的方法，所述方法包括：

a)使所述样品与第一颗粒类型接触并且将所述第一颗粒类型与所述样品一起孵育以形成第一生物分子冕，其中在所述第一颗粒类型与所述样品一起孵育时所述第一生物分子冕形成，并且其中所述第一生物分子冕包含蛋白质；

b)将包含所述第一生物分子冕的第一颗粒类型与所述样品分离；

c)使所述样品与第二颗粒类型接触并且将所述第二颗粒类型与所述样品一起孵育以形成第二生物分子冕，其中在所述第二颗粒类型与所述样品一起孵育时所述第二生物分子冕形成，其中所述第二生物分子冕包含蛋白质，并且其中(i)所述第一颗粒类型和所述第二颗粒类型是相同的颗粒类型，或者(ii)所述第一颗粒类型和所述第二颗粒类型不同；

d)将包含所述第二生物分子冕的第二颗粒类型与所述样品分离；

e)测定所述第一生物分子冕和所述第二生物分子冕，以基于所测定的第一生物分子冕和第二生物分子冕确定所述样品中的多种蛋白质的组成和浓度。

2.如权利要求1所述的方法，其中在将所述第一颗粒类型与所述样品一起孵育以形成所述第一生物分子冕时，如通过总蛋白分析方法测量的，相对于所述样品中的多种蛋白质的动态范围压缩所述第一生物分子冕中的多种蛋白质的动态范围。

3.如权利要求2所述的方法，其中所述第一生物分子冕中的多种蛋白质的动态范围是以下a)与b)的第一比率：

a)由所述第一生物分子冕中的多种蛋白质中的较高丰度蛋白产生的信号；

b)由所述第一生物分子冕中的多种蛋白质中的较低丰度蛋白产生的信号。

4.如权利要求2所述的方法，其中所述第一生物分子冕中的多种蛋白质的动态范围是所述第一生物分子冕中的多种蛋白质中的最高丰度蛋白的浓度与最低丰度蛋白的浓度的第一比率。

5.如权利要求2所述的方法，其中所述第一生物分子冕中的多种蛋白质的动态范围是所述第一生物分子冕中的多种蛋白质中的前十分位数蛋白质与后十分位数蛋白质的第一比率。

6.如权利要求2所述的方法，其中所述第一生物分子冕中的多种蛋白质的动态范围是第一比率，所述第一比率包括所述第一生物分子冕中的多种蛋白质中的蛋白质的四分间距的跨度。

7.如权利要求2所述的方法，其中所述第一生物分子冕中的多种蛋白质的动态范围是第一比率，所述第一比率包括所述第一生物分子冕中的多种蛋白质中的所有蛋白质浓度相对于所述样品中的相同蛋白质的已知浓度的曲线中的拟合数据的斜率。

8.如权利要求7所述的方法，其中从数据库获得所述样品中的相同蛋白质的已知浓度。

9.如权利要求2-8中的任一项所述的方法，其中所述样品中的多种蛋白质的动态范围是以下a)与b)的第二比率：

a)如通过总蛋白分析方法测量的，由所述样品中的多种蛋白质中的较高丰度蛋白产生的信号；

b)如通过总蛋白分析方法测量的，由所述样品中的多种蛋白质中的较低丰度蛋白产生的信号。

10.如权利要求2-8中的任一项所述的方法，其中如通过总蛋白分析方法测量的，所述样品中的多种蛋白质的动态范围是所述样品中的多种蛋白质中的最高丰度蛋白的浓度与最低丰度蛋白的浓度的第二比率。

11.如权利要求2-8中的任一项所述的方法，其中如通过总蛋白分析方法测量的，所述样品中的多种蛋白质的动态范围是所述样品中的多种蛋白质中的前十分位数蛋白质与后十分位数蛋白质的第二比率。

12.如权利要求2-8中的任一项所述的方法，其中如通过总蛋白分析方法测量的，所述样品中的多种蛋白质的动态范围是第二比率，所述第二比率包括所述样品中的多种蛋白质中的蛋白质的四分间距的跨度。