[发明专利]个体HLA分型的确定方法及其作为预测因子、靶基因和治疗剂的用途

权利要求书

1.一种确定肿瘤的个体HLA分型的方法，所述方法包括：

-确定编码第一HLA基因的第一区域的RNA转录物的第一表达水平；

-确定至少一个第二HLA基因的至少一个第二区域的有义或反义RNA转录物的至少第二表达水平；和

-比较所确定的第一和第二表达水平以获得个体HLA分型，

其中所述第一HLA基因和所述第二HLA基因选自由编码HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-D、HLA-E、HLA-F、HLA-G、HLA-H和HLA-J的基因组成的组。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一HLA基因和所述第二HLA基因编码选自由HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-D、HLA-E、HLA-F、HLA-G、HLA-H和HLA-J组成的组的不同HLA分组。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述第一HLA基因编码选自由HLA-A、HLA-B和HLA-C组成的组的第一HLA分组；并且其中所述第二HLA基因编码选自由HLA-D、HLA-E和HLA-F、HLA-G、HLA-H和HLA-J组成的组的第二HLA分组。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一HLA基因和所述第二HLA基因相同或编码相同HLA分组。

5.根据在前权利要求所述的方法，其中所述第一表达水平与所述HLA分组的有义RNA转录物相关，而所述第二表达水平与所述HLA分组的反义RNA转录物相关。

6.根据在前权利要求之一所述的方法，其中

-所述第一区域和所述第二区域中的一个包含外显子-外显子-边界，而所述第一区域和所述第二区域中的另一个不包含外显子-外显子-边界，或其中

-所述第一区域不包含外显子-外显子-边界并且所述第二区域不包含外显子-外显子-边界，或其中

-所述第一区域包含外显子-外显子-边界并且所述第二区域包含外显子-外显子-边界。

7.根据在前权利要求之一所述的方法，其中

-所述第一区域和所述第二区域中的至少一个编码HLA分组的信号肽区域，和/或

-所述第一区域和所述第二区域中的至少一个编码HLA分组的跨膜区。

8.根据在前权利要求之一所述的方法，进一步包括

-基于所述第一和第二表达水平的比较来确定所述个体HLA分型主要是可溶的还是膜结合的。

9.根据在前权利要求之一所述的方法，进一步包括

-基于所述第一和第二表达水平的比较来确定HLA同种型。

10.根据在前权利要求之一所述的方法，还包括确定编码HLA分组的基因的一或多个其他区域的一或多个其他表达水平，并且其中所述比较进一步基于所确定的其他表达水平以获得所述个体HLA分型。

11.根据在前权利要求之一所述的方法，其中所述比较包括形成表达水平比率。

12.根据SEQ ID NO：1至69之一的核酸分子，特别用作引物和/或探针。

13.一种试剂盒，其包含根据在前权利要求所述的核酸分子。

14.根据在前权利要求所述的试剂盒用于鉴定肿瘤的分子亚型的用途。

15.一种生产治疗剂的方法，所述方法包括

-使用根据权利要求1至11之一所述的方法确定个体HLA分型；以及

-基于所确定的个体HLA分型生产治疗剂，使得所述治疗剂特异性结合所确定的个体HLA分型，其中所述治疗剂包含蛋白、蛋白结构域和/或多肽。