[发明专利]使用肠道微生物预测或诊断疾病风险的组合物、使用肠道微生物的诊断试剂盒、提供信息的方法以及筛选用于预防或治疗糖尿病的试剂的方法

权利要求书

1.一种使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法，所述方法包括从获得自对象肠道来源的样品的微生物基因组DNA检测选自毛螺菌属菌株、粪球菌属菌株、卵形布劳特氏菌菌株、殊异韦荣菌菌株、毛螺菌科菌株、单形拟杆菌菌株、粪拟杆菌菌株、副拟杆菌属菌株和产甲酸多尔氏菌菌株的一种或多于一种菌株的步骤，所述方法包括：

(a)比较选自毛螺菌属菌株和粪球菌属菌株的一种或多于一种菌株与正常组相比增加或减少，和如果微生物基因组DNA中的毛螺菌属菌株增加或粪球菌属菌株减少，则诊断对象为糖尿病组或糖尿病风险组的步骤，

(b)比较选自卵形布劳特氏菌菌株、殊异韦荣菌菌株和毛螺菌科菌株的一种或多于一种菌株与正常组相比增加或减少，和如果微生物基因组DNA中的卵形布劳特氏菌菌株减少、殊异韦荣菌菌株增加或毛螺菌科菌株减少，则诊断对象为肥胖症组或肥胖症风险组的步骤；

(c)比较选自单形拟杆菌菌株、粪拟杆菌菌株和副拟杆菌属菌株的一种或多于一种菌株与正常组相比增加或减少，和如果微生物基因组DNA中的单形拟杆菌菌株减少、粪拟杆菌菌株减少或副拟杆菌属菌株减少，则诊断对象为肝病组或肝病风险组的步骤；或

(d)比较选自殊异韦荣菌菌株、毛螺菌属菌株和产甲酸多尔氏菌菌株的一种或多于一种菌株与正常组相比增加或减少，和如果微生物基因组DNA中的殊异韦荣菌菌株增加、毛螺菌属菌株减少或产甲酸多尔氏菌菌株增加，则诊断对象为肾病组或肾病风险组的步骤。

2.根据权利要求1所述的使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法，其中

在步骤(a)中，毛螺菌属菌株包含SEQ ID NO 1的16S rRNA碱基序列，且粪球菌属菌株包含SEQ ID NO 2的16S rRNA碱基序列，

在步骤(b)中，卵形布劳特氏菌菌株包含SEQ ID NO 9的16S rRNA碱基序列，殊异韦荣菌菌株包含SEQ ID NO 10的16S rRNA碱基序列，且毛螺菌科菌株包含SEQ ID NO 11的16SrRNA碱基序列，

在步骤(c)中，单形拟杆菌菌株包含SEQ ID NO 28至SEQ ID NO 32的16S rRNA碱基序列，粪拟杆菌菌株包含SEQ ID NO 33和SEQ ID NO 34的16S rRNA碱基序列，且副拟杆菌属菌株包含SEQ ID NO 35的16S rRNA碱基序列，和

在步骤(d)中，殊异韦荣菌菌株包含SEQ ID NO 10的16S rRNA碱基序列，毛螺菌属菌株包含SEQ ID NO 36的16S rRNA碱基序列，且产甲酸多尔氏菌菌株包含SEQ ID NO 37的16SrRNA碱基序列。

3.根据权利要求1所述的使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法，所述方法包括：

在步骤(a)中还从获得自对象肠道来源的样品的微生物基因组DNA检测粪杆菌属菌株的步骤；和

比较在获得自对象肠道来源的样品的微生物基因组DNA中的粪杆菌属菌株与正常组相比增加或减少，和如果粪杆菌属菌株减少，则诊断对象为糖尿病组或糖尿病风险组的步骤。

4.根据权利要求3所述的使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法，其中粪杆菌属菌株包含SEQ ID NO 3或SEQ ID NO 4的16S rRNA碱基序列。

5.根据权利要求3所述的使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法，所述方法包括：

在步骤(a)中还从获得自对象肠道来源的样品的微生物基因组DNA检测肠杆菌科菌株或瘤胃球菌科菌株的步骤；和

比较在获得自对象肠道来源的样品的微生物基因组DNA中的肠杆菌科菌株或瘤胃球菌科菌株与正常组相比增加或减少，和如果肠杆菌科菌株增加或瘤胃球菌科菌株减少，则诊断对象为糖尿病组或糖尿病风险组的步骤。

6.根据权利要求5所述的使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法，其中肠杆菌科菌株包含选自SEQ ID NO 5、SEQ ID NO 6和SEQ ID NO 7的16S rRNA碱基序列的任一序列，且瘤胃球菌科菌株包含SEQ IDNO 8的16S rRNA碱基序列。