[发明专利]使用肠道微生物预测或诊断疾病风险的组合物、使用肠道微生物的诊断试剂盒、提供信息的方法以及筛选用于预防或治疗糖尿病的试剂的方法

说明书

本发明涉及通过使用肠道微生物预测或诊断选自糖尿病、肥胖症、肝病和肾病的一种或多于一种疾病的风险的组合物、预测诊断疾病风险的包含组合物的诊断试剂盒、提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法、筛选用于预防或治疗疾病的试剂的方法。本发明使得通过能够检测生物标志物菌株的试剂预测或诊断疾病风险成为可能，所述生物标志物菌株可以检测疾病、筛选用于预测或诊断疾病的试剂。

技术领域

本公开涉及使用肠道微生物预测或诊断疾病风险的组合物、使用肠道微生物预测或诊断疾病风险的诊断试剂盒、使用肠道微生物提供用于预测或诊断疾病风险的信息的方法、使用肠道微生物筛选用于预防或治疗疾病的试剂的方法。

背景技术

随着新一代测序技术的发展，快速准确地测量人类肠道微生物的相对量成为可能。特别地，使用16S核糖体RNA的可变区序列即肠道微生物的共同保守区，利用这项技术研究人类肠道中微生物的相对量已经成为可能，并且正在进行研究以阐明个体疾病相关的信息和生物标志物之间的关系。

韩国专利注册第1445243号涉及一种使用肠道微生物预测或诊断代谢和炎症疾病包括糖尿病的组合物，并使用由嗜黏蛋白阿克曼菌(Akkermansia muciniphila)、拟杆菌(Bacteroides spp.)、优杆菌(Eubacterium spp.)、罗氏菌(Roseburia spp.)、史氏甲烷短杆菌(Methanobrevibacter smithii)、斯氏甲烷球形菌(Methanosphaera stadtmanae)、卵形瘤胃球菌(Ruminococcus obeum)和考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)组成的微生物群作为与糖尿病相关的微生物。然而，从15对双胞胎的粪便样品中获得的结果在概括上是有限的。

欧洲专利注册第2563930号提出了一种通过分析柔嫩梭菌(Clostridium leptum)菌群的多样性来诊断1型糖尿病风险的方法，所述柔嫩梭菌菌群由普氏粪杆菌(Faecalibacterium prausnitzii)、白色瘤胃球菌(Ruminococcus albus)、布氏瘤胃球菌(Rhminococccus bromii)、伶俐瘤胃球菌(Rouminococcus callidus)、黄化瘤胃球菌(Ruminococcus flafafaciens)等。

韩国专利注册第1940445号提出了一种通过使用血液或尿液样品中细菌分泌的细胞外囊泡进行宏基因组分析来诊断糖尿病的方法。

然而，上述专利提出的结果与本公开的发明人通过研究从890名韩国人获得的微生物组与糖尿病之间在生物标志物微生物的方面的关系、微生物的组合、用于识别微生物的特征碱基序列以及高风险组中微生物的增长模型获得的结果不同，所述生物标志物微生物可以区分高血糖的高风险组和血糖正常的正常组。

同时，韩国专利注册第1445243号涉及一种使用肠道微生物群预测或诊断代谢性和炎症性疾病包括肥胖症症的组合物。尽管由嗜黏蛋白阿克曼菌、拟杆菌属、罗氏菌属、史氏甲烷短杆菌、斯氏甲烷球形菌、卵形瘤胃球菌属和考拉杆菌属组成的微生物群被用作与肥胖症相关的微生物，但在概括从15对双胞胎的粪便样品中获得的结果方面存在局限性。

韩国专利公开第2019-00039502号描述了增加选自普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、黄曲霉属(Flavonifractor)、梭菌属IV(Clostridium IV)和丁酸球菌(Butyriccoccus)的细菌或增加选自红蝽菌科(Coriobacteriae)、乳杆菌科(Lactobacteriaceae)和理研菌科(Rikenellaceae)的细菌用于治疗肥胖症相关疾病。

韩国专利注册第1940445号提出了一种通过使用血液或尿液样品中细菌分泌的细胞外囊泡进行宏基因组分析来诊断糖尿病的方法。