[发明专利]一种用于实时荧光RAA检测环孢子虫DNA的引物探针组合物和试剂盒及其应用在审
申请号: | 202110053056.3 | 申请日: | 2021-01-15 |
公开(公告)号: | CN112646911A | 公开(公告)日: | 2021-04-13 |
发明(设计)人: | 沈玉娟;姜岩岩;许洁;曹建平;应清界;刘燕红;顾赛艺 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心);江苏奇天基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人: | 王函 |
地址: | 200025 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 实时 荧光 raa 检测 孢子 dna 引物 探针 组合 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种用于实时荧光RAA法检测环孢子虫DNA的引物探针组合物,其特征在于,包括:核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的上游引物,核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的下游引物;以及核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示的探针。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合物,其特征在于,所述探针为在SEQ ID No.7所示序列的第31位碱基修饰荧光报告基团、第35位碱基修饰淬灭基团和第33位碱基修饰四氢呋喃残基的物质。
3.根据权利要求2所述的引物探针组合物,其特征在于,所述荧光报告基团选自FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3和Cy5中的任意一种。
4.根据权利要求2或3所述的引物探针组合物,其特征在于,所述淬灭基团选自TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3和DABCYL中的任意一种。
5.一种试剂盒,包括权利要求1~4任意一项所述的引物探针组合物、RAA基础荧光通用反应试剂、反应缓冲液、阴性质控品、阳性质控品。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括:所述引物探针组合物40~80μL,所述上游引物和下游引物的独立浓度为0.03~0.07mM,所述探针的浓度为0.01~0.03mM;24管RAA基础荧光通用反应试剂冻干粉;反应缓冲液1000~1800μL;阴性质控品25~35μL;浓度为1.0×105copies/μL的阳性质控品。
7.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于,所述阴性质控品为ddH2O。
8.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性质控品为含有环孢子虫DNA片段的质粒,所述环孢子虫DNA片段的序列如SEQ ID No.10所示。
9.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于,所述RAA基础荧光通用反应试剂组份包含重组酶,DNA聚合酶,单链DNA结合蛋白,dNTPs。
10.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于,所述反应缓冲液包括:450~550mM的Tris-HCl、200~300mM的MgAc和质量体积百分含量为5~15%的PEG10000。
11.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒在使用时,实时荧光RAA反应体系每50μL包括:RAA基础荧光通用反应试剂冻干粉,47μL反应缓冲液,2μL引物探针组合物,1μL样品、阴性质控品、阳性质控品;
所述实时荧光RAA反应的条件包括:所述实时荧光RAA反应的温度为25~42℃,所述实时荧光RAA反应的时间为15~25min。
12.如权利要求1~4任意一项所述的引物探针组合物在制备环孢子虫检测产品中的应用。
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