[发明专利]一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记及其应用有效
申请号: | 202110053275.1 | 申请日: | 2021-01-15 |
公开(公告)号: | CN112626260B | 公开(公告)日: | 2022-06-17 |
发明(设计)人: | 王志慧;廖伯寿;雷永;晏立英;陈玉宁;淮东欣;王欣;康彦平 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院油料作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 商秀玲 |
地址: | 430062 湖北省武汉市武昌*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 花生 百仁重主效 qtl 连锁 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记组合,其特征在于,所述分子标记组合由分子标记Ah011476和分子标记Ah011478组成;
所述分子标记Ah011476位于花生B06染色体上如SEQ ID NO.7所示核苷酸序列的第22位,多态性为G或T;
所述分子标记Ah011478位于花生B06染色体上如SEQ ID NO.8所示核苷酸序列的第24位,多态性为C或A。
2.一种用于扩增如权利要求1所述分子标记组合的KASP引物组合,其特征在于,所述KASP引物组合包括,用于检测分子标记Ah011476的KASP引物组合1和用于检测分子标记Ah011478的引物组合2;
所述引物组合1包括:
Allele-specific-FAM-F:5’-GTAGTTGCCGTGTTTGGCG-3’,
Allele-specific-VIC-F:5’-TCTGTAGTTGCCGTGTTTGGCT-3’,
Common-primer-R:5’-GAAGCTGAAAAGCTTGAGCCTCGTT-3’;
所述引物组合2包括:
Allele-specific-FAM-F:5’-GCGCTGTTTGTTGTGCTGTGC-3’,
Allele-specific-VIC-F:5’-ATAGCGCTGTTTGTTGTGCTGTGA-3’,
Common-primer-R:5’-CCAGTTAACAAATCTCAACCTATAGATGAA-3’ 。
3.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求2所述的KASP引物组合。
4.一种检测花生百仁重的方法,其特征在于,包括:
提取待鉴定花生材料的DNA,通过PCR对所述待鉴定花生材料的如权利要求1所述分子标记组合进行鉴定;
若鉴定分子标记Ah011476的多态性为G,且鉴定分子标记Ah011478的基因型多态性为C,则所述待鉴定花生材料为高百仁重;
若鉴定分子标记Ah011476的多态性为T,且鉴定分子标记Ah011478的基因型多态性为A,则所述待鉴定花生材料为低百仁重。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述PCR的反应程序为:
94℃ 15min;94℃ 20s, 61~55℃ 60s,10个循环,且每个循环降低0.6℃;95℃ 20s,55℃ 60s,27个退火循环。
6.权利要求1所述分子标记组合、或权利要求2所述引物组合、或权利要求3所述试剂盒、或权利要求4或5所述方法在花生遗传改良中的应用。
7.权利要求1所述分子标记组合、或权利要求2所述引物组合、或权利要求3所述试剂盒、或权利要求4或5所述方法在高百仁重花生选育中的应用。
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