[发明专利]一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子遗传学和作物分子育种技术领域，尤其涉及一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记及其应用。所述分子标记包括分子标记Ah011476，和/或，分子标记Ah011478；所述分子标记Ah011476为花生B06染色体上第14206230位，多态性为G或T；所述分子标记Ah011478为花生B06染色体上第17650027位，多态性为C或A。本发明筛选得到和花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记，使用这些分子标记可以有效地对花生的百仁重进行鉴定，并用于花生遗传改良，获得高百仁重的花生品种。

技术领域

本发明涉及分子遗传学和作物分子育种技术领域，尤其涉及一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记及其应用。

背景技术

花生(Arachis hypogaea L.)是现有重要的油料作物和经济作物之一，种植面积大，产量高，可用于榨油，是目前重要的食用油来源之一。花生同时也是重要的食品加工原料，食品消费占总产的35％以上。目前，提高单位面积产量是进一步增加花生原料供给的有效途径之一。研究表明，花生百仁重对产量影响最大，是花生最重要的花生产量构成因子。因此，开展花生百仁重QTL定位研究，鉴定百仁重相关的QTL并开发成分子标记，对于揭示花生籽仁大小形成的机理、开展百仁重的分子标记辅助选择育种和培育高产品种具有重要的意义。

分子标记辅助育种技术是现阶段创造优异性状材料和培育优良品种的重要手段和技术，其应用可以大大加速育种的进程和速度，具体通过在杂交和回交过程中使用性状连锁分子标记对杂交群体中的重组个体进行精确筛选，将筛选到携带优异等位基因的个体继续用于后续杂交和回交过程，实现优异性状遗传位点的精准导入和转育，从而快速实现作物品种的性状改良。应用分子标记开展辅助育种的基础是鉴定到与性状紧密连锁且高度相关的分子标记，分子标记在育种中的效率与标记与性状的连锁紧密程度、表型贡献率密切相关，质量性状和数量性状主效QTL分子标记在辅助选择育种中的效果较好。花生的百仁重属于数量性状，其遗传机理非常复杂，受多基因控制且与环境存在互作，充分发掘花生百仁重相关的主效QTL位点紧密连锁的分子标记，有助于聚合多个百仁重主效QTL位点，加快高产品种选育进程。目前，国内外学者对花生百仁重QTL定位有一些报道(Wang et al.,2019；Huang et al.,2015；Fonceka et al.,2012；Li et al.,2011；Ravi et al.,2011)，但这些研究鉴定的QTL通常由于标记密度过于稀疏，导致鉴定到的QTL区间较大，连锁的分子标记的表型贡献率通常较低，其鉴定的百仁重连锁标记应用于分子育种的效果一般。

发明内容

为了解决现有技术的问题，本发明提供一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记及其应用。

第一方面，本发明提供一种与花生百仁重主效QTL位点连锁的分子标记，所述分子标记包括分子标记Ah011476，和/或，分子标记Ah011478；

所述分子标记Ah011476为花生B06染色体上第14206230位，多态性为G或T；

所述分子标记Ah011478为花生B06染色体上第17650027位，多态性为C或A。

进一步地，所述分子标记Ah011476位于如SEQ ID NO.7所示核苷酸序列的第22位；SEQ ID NO.7所示序列为用Allele-specific-VIC-F和Common-primer-R扩增得到的序列，而Allele-specific-FAM-F和Common-primer-R的扩增得到的片段，分子标记Ah011476位于第19位。

所述分子标记Ah011478位于如SEQ ID NO.8所示核苷酸序列的第24位；SEQ IDNO.8所示序列为用Allele-specific-VIC-F和Common-primer-R扩增得到的序列，而Allele-specific-FAM-F和Common-primer-R的扩增得到的片段，分子标记Ah011476位于第21位。