[发明专利]肺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备在审
申请号: | 202110061920.4 | 申请日: | 2021-01-18 |
公开(公告)号: | CN112735592A | 公开(公告)日: | 2021-04-30 |
发明(设计)人: | 张蕾;张琦;冯林;程书钧;张开泰;肖汀 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院肿瘤医院 |
主分类号: | G16H50/50 | 分类号: | G16H50/50;G16H50/30;G16B20/00 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 彭久云 |
地址: | 100021 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 预后 模型 构建 方法 应用 电子设备 | ||
1.一种肺癌预后模型的构建方法,包括:
获取多个肺癌患者和多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据;
基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据,筛选候选基因;以及
基于所述候选基因,构建风险评分模型;
其中,所述肺癌预后模型包括所述风险评分模型,
基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据,筛选所述候选基因,包括:
对所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据进行相似性分析,确定多个肺癌亚群;
将所述多个肺癌亚群分别与所述多个参考人进行差异表达基因分析,确定所述多个肺癌亚群各自的差异表达基因;
比较所述多个肺癌亚群的差异表达基因的表达状态,选择所述多个肺癌亚群中有较多的免疫抑制基因处于高表达状态的肺癌亚群作为候选肺癌亚群,其中,所述高表达状态是指免疫抑制基因的表达值大于所述多个参考人的所述免疫抑制基因的表达值;以及
从所述候选肺癌亚群的差异表达基因中筛选所述候选基因。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其中,基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据,筛选所述候选基因,还包括:
在确定所述多个肺癌亚群之后,通过血液转录组模块富集分析对所述多个肺癌亚群进行验证。
3.根据权利要求1或2所述的构建方法,其中,所述多个肺癌亚群包括两个肺癌亚群。
4.根据权利要求1或2所述的构建方法,其中,基于所述候选基因,构建所述风险评分模型,包括:
获取训练数据集;
在所述训练数据集中,基于所述候选基因,通过单因素Cox回归分析,确定与生存期相关的基因;以及
通过LASSO Cox回归分析结合十折交叉验证法,对所述与生存期相关的基因进行筛选,以确定用于构建所述风险评分模型的基因以及所述风险评分模型,其中,所述风险评分模型表示为:
RS=c1E1+…+cNEN,
其中,RS表示风险评分,Ei表示用于构建所述风险评分模型的第i个基因的表达值,ci表示用于构建所述风险评分模型的第i个基因的系数,N表示用于构建所述风险评分模型的基因的数量。
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