[发明专利]肺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备

说明书

一种肺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备及存储介质。该构建方法包括：获取多个肺癌患者和多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据；基于上述转录谱表达数据，筛选候选基因；以及，基于候选基因，构建风险评分模型。肺癌预后模型包括风险评分模型。基于上述转录谱表达数据，筛选候选基因，包括：对上述转录谱表达数据进行相似性分析，确定多个肺癌亚群；将多个肺癌亚群分别与多个参考人进行差异表达基因分析，确定多个肺癌亚群各自的差异表达基因；比较多个肺癌亚群的差异表达基因中的表达状态，选择多个肺癌亚群中有较多的免疫抑制基因处于高表达状态的肺癌亚群作为候选肺癌亚群；以及，从候选肺癌亚群的差异表达基因中筛选候选基因。

技术领域

本公开的实施例涉及一种肺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备及存储介质。

背景技术

预后是指根据经验预测的疾病发展情况。预后主要涉及到三个方面，将发生什么结果、发生不良结果的可能性以及时间点。研究和评级预后的目的，在于便于了解疾病对人类危害性的大小、探索影响预后的因素、研究改善预后的具体措施。预后分析是临床非常实用、对临床很有指导作用的临床研究。

肺癌(lung cancer，LC)作为一种高度异质性疾病，其预后差、死亡率高，居全球癌症死因之首。目前，肺癌患者的治疗和预后预测主要基于肿瘤淋巴结转移(Tumor-Node-Metastasis，TNM)分期系统。然而，即使临床特征相同的患者之间的生存率也存在很大差异。基于此，已有研究开发出一些分子预后辅助指标以期提高对肺癌预后预测的准确性。然而绝大多数研究以肿瘤组织特征为研究基础，忽视了瘤内异质性及取样偏倚对筛选出的预后标志物的有效性及应用广泛性的限制。因此，需要开发更为可靠的预后生物标志物来指导肺癌辅助治疗。

发明内容

本公开至少一些实施例提供一种肺癌预后模型的构建方法。该构建方法包括：获取多个肺癌患者和多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据；基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据，筛选候选基因；以及，基于所述候选基因，构建风险评分模型。所述肺癌预后模型包括所述风险评分模型。基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据，筛选所述候选基因，包括：对所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据进行相似性分析，确定多个肺癌亚群；将所述多个肺癌亚群分别与所述多个参考人进行差异表达基因分析，确定所述多个肺癌亚群各自的差异表达基因；比较所述多个肺癌亚群的差异表达基因的表达状态，选择所述多个肺癌亚群中有较多的免疫抑制基因处于高表达状态的肺癌亚群作为候选肺癌亚群，其中，所述高表达状态是指免疫抑制基因的表达值大于所述多个参考人的所述免疫抑制基因的表达值；以及，从所述候选肺癌亚群的差异表达基因中筛选所述候选基因。

例如，在本公开一些实施例提供的构建方法中，基于所述多个肺癌患者和所述多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据，筛选所述候选基因，还包括：在确定所述多个肺癌亚群之后，通过血液转录组模块富集分析对所述多个肺癌亚群进行验证。

例如，在本公开一些实施例提供的构建方法中，所述多个肺癌亚群包括两个肺癌亚群。

例如，在本公开一些实施例提供的构建方法中，基于所述候选基因，构建所述风险评分模型，包括：获取训练数据集；在所述训练数据集中，基于所述候选基因，通过单因素Cox回归分析，确定与生存期相关的基因；以及，通过LASSO Cox回归分析结合十折交叉验证法，对所述与生存期相关的基因进行筛选，以确定用于构建所述风险评分模型的基因以及所述风险评分模型，其中，所述风险评分模型表示为：

RS＝c₁E₁+…+c_NE_N，

其中，RS表示风险评分，E_i表示用于构建所述风险评分模型的第i个基因的表达值，c_i表示用于构建所述风险评分模型的第i个基因的系数，N表示用于构建所述风险评分模型的基因的数量。