[发明专利]用于检测GCK-MODY基因突变的方法及其试剂盒有效

专利信息
申请号: 202110064171.0 申请日: 2021-01-18
公开(公告)号: CN112779321B 公开(公告)日: 2021-10-29
发明(设计)人: 徐涛;周凯欣;黄蓉;赵晶;刘子青;郑丽 申请(专利权)人: 生物岛实验室;中国科学院大学
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京睿阳联合知识产权代理有限公司 11758 代理人: 郭奥博;张颖
地址: 510320 广东省广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 gck mody 基因突变 方法 及其 试剂盒
【权利要求书】:

1.用于确定GCK-MODY单基因遗传病进行GCK基因检测的DNA混合样本数目的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:

(1)确定人群中GCK-MODY单基因遗传病的发病率;以及

(2)根据以下公式计算混合的DNA样本数目:

-1/2+sqrt(1/4+1/a%)<n1/2+sqrt(1/4+1/a%)

其中,a%为发病率,n为混合的样本数目,sqrt表示求平方根的函数。

2.用于在人群中扩增GCK-MODY单基因遗传病的GCK基因和/或在人群中检测GCK-MODY单基因遗传病的GCK基因突变的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:

(1)确定人群中GCK-MODY单基因遗传病的发病率;

(2)根据以下公式计算混合的DNA样本数目:

-1/2+sqrt(1/4+1/a%)<n1/2+sqrt(1/4+1/a%),

其中,a%为发病率,n为混合的样本数目,sqrt表示求平方根的函数;

(3)将第(2)步确定的DNA样本数目的样本混合;

(4)利用引物组对步骤(3)获得的DNA混合样本进行PCR反应,从而扩增出GCK-MODY单基因遗传病的GCK基因作为扩增产物,

所述方法为非诊断目的。

3.根据权利要求2的方法,其特征在于利用SEQ ID NO:1-22所示的核苷酸序列作为正向引物,以及SEQ ID NO:23-44所示的核苷酸序列作为反向引物;或利用SEQ ID NO:45-66所示的核苷酸序列作为正向引物,以及SEQ ID NO:67-88所示的核苷酸序列作为反向引物。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于所述方法还包括以下步骤:

(a)对第(4)步获得的扩增产物进行纯化;

(b)对步骤(a)获得的纯化产物构建文库;

(c)对步骤(b)获得的文库进行纯化;以及

(d)对步骤(c)获得的纯化文库进行测序。

5.根据权利要求4所述的方法,其中:所述测序为第二代测序。

6.根据权利要求4所述的方法,其中:采用磁珠进行纯化。

7.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应的退火温度为58-64℃。

8.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应的退火温度为60℃。

9.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应中的退火温度为58-64℃。

10.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应中的退火温度为60℃。

11.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应进行32-37个循环。

12.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应进行35个循环。

13.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应进行6-10个循环。

14.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应进行8个循环。

15.根据权利要求4所述的方法,其中:在测序之前还包括测定文库浓度的步骤和/或文库质检的步骤。

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