[发明专利]用于检测GCK-MODY基因突变的方法及其试剂盒有效
申请号: | 202110064171.0 | 申请日: | 2021-01-18 |
公开(公告)号: | CN112779321B | 公开(公告)日: | 2021-10-29 |
发明(设计)人: | 徐涛;周凯欣;黄蓉;赵晶;刘子青;郑丽 | 申请(专利权)人: | 生物岛实验室;中国科学院大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京睿阳联合知识产权代理有限公司 11758 | 代理人: | 郭奥博;张颖 |
地址: | 510320 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 gck mody 基因突变 方法 及其 试剂盒 | ||
1.用于确定GCK-MODY单基因遗传病进行GCK基因检测的DNA混合样本数目的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:
(1)确定人群中GCK-MODY单基因遗传病的发病率;以及
(2)根据以下公式计算混合的DNA样本数目:
-1/2+sqrt(1/4+1/a%)<n1/2+sqrt(1/4+1/a%)
其中,a%为发病率,n为混合的样本数目,sqrt表示求平方根的函数。
2.用于在人群中扩增GCK-MODY单基因遗传病的GCK基因和/或在人群中检测GCK-MODY单基因遗传病的GCK基因突变的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:
(1)确定人群中GCK-MODY单基因遗传病的发病率;
(2)根据以下公式计算混合的DNA样本数目:
-1/2+sqrt(1/4+1/a%)<n1/2+sqrt(1/4+1/a%),
其中,a%为发病率,n为混合的样本数目,sqrt表示求平方根的函数;
(3)将第(2)步确定的DNA样本数目的样本混合;
(4)利用引物组对步骤(3)获得的DNA混合样本进行PCR反应,从而扩增出GCK-MODY单基因遗传病的GCK基因作为扩增产物,
所述方法为非诊断目的。
3.根据权利要求2的方法,其特征在于利用SEQ ID NO:1-22所示的核苷酸序列作为正向引物,以及SEQ ID NO:23-44所示的核苷酸序列作为反向引物;或利用SEQ ID NO:45-66所示的核苷酸序列作为正向引物,以及SEQ ID NO:67-88所示的核苷酸序列作为反向引物。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于所述方法还包括以下步骤:
(a)对第(4)步获得的扩增产物进行纯化;
(b)对步骤(a)获得的纯化产物构建文库;
(c)对步骤(b)获得的文库进行纯化;以及
(d)对步骤(c)获得的纯化文库进行测序。
5.根据权利要求4所述的方法,其中:所述测序为第二代测序。
6.根据权利要求4所述的方法,其中:采用磁珠进行纯化。
7.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应的退火温度为58-64℃。
8.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应的退火温度为60℃。
9.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应中的退火温度为58-64℃。
10.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应中的退火温度为60℃。
11.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应进行32-37个循环。
12.根据权利要求4所述的方法,其中:所述PCR反应进行35个循环。
13.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应进行6-10个循环。
14.根据权利要求4所述的方法,其中:所述构建文库反应进行8个循环。
15.根据权利要求4所述的方法,其中:在测序之前还包括测定文库浓度的步骤和/或文库质检的步骤。
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