[发明专利]用于检测GCK-MODY基因突变的方法及其试剂盒有效
申请号: | 202110064171.0 | 申请日: | 2021-01-18 |
公开(公告)号: | CN112779321B | 公开(公告)日: | 2021-10-29 |
发明(设计)人: | 徐涛;周凯欣;黄蓉;赵晶;刘子青;郑丽 | 申请(专利权)人: | 生物岛实验室;中国科学院大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京睿阳联合知识产权代理有限公司 11758 | 代理人: | 郭奥博;张颖 |
地址: | 510320 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 gck mody 基因突变 方法 及其 试剂盒 | ||
本发明提供了对人群单基因遗传病进行基因检测时确定DNA混合样本(DNA pooling)数目的方法,可以适用于大量样本的高效分析,并且可以显著降低对人群单基因遗传病进行基因检测的成本。结合本发明提供的引物组可以实现对大量样本的GCK‑MODY测序和GCK基因突变的检测。
技术领域
本发明属于基因检测领域,具体地涉及与疾病相关的基因的检测。
背景技术
单基因遗传病是单个基因变异引起的遗传病,是受一对等位基因控制的遗传病。目前已知的很多遗传病都属于单基因病,如血友症、色盲、多指、并指、苯丙酮尿症等等。遗传病一般困扰终生、难以治疗,有些即使可以治疗,费用也十分昂贵,更重要的是,患者可能将突变的基因遗传给下一代。单基因遗传病通常发病率较低。
隐性单基因遗传病患儿双亲往往没有任何症状,常规产检难以检出,直到患儿出生后才发现病症。如夫妻双方在备孕期或孕早期进行单基因遗传病携带者筛查,及时发现致病变异携带情况,提示生育患儿的风险,可通过遗传咨询、产前检测或诊断、辅助生殖技术等有效预防部分单基因遗传病出生缺陷的首次发生。
而且,通过基因测序对临床症状不明显的发病率很低的单基因遗传病进行大规模人群的检测筛选时,成本极高,严重阻碍了基因测序在单基因遗传病检测中的推广应用。
青少年发病的成人型糖尿病(MODY)就是一种由于单基因突变导致的糖尿病,该病的特征表现为:发病年龄早,常染色体显性遗传。葡萄糖激酶(GCK)单基因突变导致的MODY2(GCK-MODY)是最常见的MODY亚型之一。GCK-MODY患者血糖感知能力上调,从出生起就表现为轻微的血糖升高,由于缺乏对该疾病的重视,且GCK-MODY患者无明显的特异性临床表现,许多GCK-MODY患者被错误的诊断为I型或II型糖尿病。此外,无症状的GCK-MODY患者在妊娠期糖筛时可被诊断为妊娠糖尿病,但是GCK-MODY患者在妊娠期需根据胎儿是否遗传到GCK突变来采取特异性干预措施:当胎儿未遗传到母亲的GCK突变时,需对孕妇进行胰岛素治疗,防止胎儿过度生长出现巨大儿,导致不良妊娠结局;当胎儿遗传到母亲的GCK突变时,则胎儿与母亲的葡萄糖感知能力处于同时上调状态,无需进行干预,若使用胰岛素过度治疗将导致胎儿生长发育迟缓。
MODY大约占糖尿病人群的1-2%,但是由于GCK-MODY患者没有特异性的临床表型特征,其诊断的基础是基因测序。传统的基因测序包括全基因组测序、全外显子测序等,是一项成本极高的检查,从而导致存在基因检测的推广难度大的瓶颈。因此,目前需要既能实现对大规模人群,
比如孕妇高通量检测GCK-MODY,同时降低GCK-MODY检测成本的方法,从而对GCK-MODY进行精准诊疗,尤其是实现对孕妇中GCK-MODY患者的精准筛查,有助于减少不良妊娠结局,改善孕期和围产期精准护理,促进优生优育。
发明内容
本发明提供了对人群单基因遗传病进行基因检测时确定DNA混合样本(DNApooling)数目的方法,将待检测DNA样本混合的策略是将多个个体的DNA样本按照一定比例混合后再进行PCR、位点扫描和分型的方法,可以适用于大量样本的高效分析,并且可以显著降低对人群单基因遗传病进行基因检测的成本,而且准确性较高。
将所述确定DNA混合样本数目的方法应用于在糖尿病和自然人群中检测GCK-MODY患者时,发现可将检测成本降至百元以下,甚至是50元以下,从而可实现大规模的人群筛查,惠及更多的人群,尤其是孕妇,解决了由于检测费用高而导致的基因检测推广难度大的问题。
DNA混合样本(DNA pooling)策略具有低成本、效率高的优点,可以对大量样本进行高效分析,但是前提也需要超高灵敏度和超高特异性的PCR检测系统。
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