[发明专利]一种用于扩增西瓜潜隐病毒的引物对及其应用有效
申请号: | 202110069899.2 | 申请日: | 2021-01-19 |
公开(公告)号: | CN113005224B | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 赵立群;邱艳红;徐秀兰;田文;张海军;张晓飞;刘慧;温常龙 | 申请(专利权)人: | 北京市农业技术推广站;北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙) 11387 | 代理人: | 荣红颖;张洪生 |
地址: | 100029 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 扩增 西瓜 潜隐 病毒 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于扩增西瓜潜隐病毒基因组片段的引物对,所述引物对由第一引物和第二引物组成;
所述第一引物的核酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述第二引物的核酸序列如SEQ IDNO.2所示。
2.一种用于扩增西瓜潜隐病毒基因组片段的试剂,所述试剂包括权利要求1所述的引物对。
3.如权利要求2所述的试剂,其特征在于,所述第一引物与所述第二引物的摩尔比为1:1;
所述试剂还包括反转录酶和/或DNA聚合酶;
所述试剂还包括阳性对照样品。
4.一种用于扩增西瓜潜隐病毒基因组片段的试剂盒,所述试剂盒中含有权利要求1所述的引物对或权利要求2或3所述的试剂。
5.权利要求1所述的引物对、权利要求2或3所述的试剂或权利要求4所述的试剂盒在如下a1或a2中的应用:
a1、检测西瓜潜隐病毒;
a2、制备检测西瓜潜隐病毒的制剂。
6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,a1是指:
检测待测植物材料是否感染西瓜潜隐病毒;或
检测待测病毒是否为西瓜潜隐病毒;
a2是指:
制备检测待测植物材料是否感染西瓜潜隐病毒的制剂;或
制备检测待测病毒是否为西瓜潜隐病毒的制剂。
7.一种检测待测植物材料是否感染西瓜潜隐病毒的方法,所述方法包括:
b1、采用权利要求1所述的引物对对所述待测植物材料的核酸进行PCR扩增;
b2、根据所述扩增的产物确定所述待测植物材料是否感染西瓜潜隐病毒。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述待测植物材料为西瓜叶片或西瓜种子。
9.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述待测植物材料的核酸为所述待测植物材料的总RNA。
10.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增为RT-PCR扩增。
11.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述确定的步骤为:表征所述PCR扩增产物中的DNA片段,当所述PCR扩增产物中没有588bp的DNA片段时,判定所述待测植物材料中没有感染所述西瓜潜隐病毒;当所述PCR扩增产物中含有588bp的DNA片段时,判定所述待测植物材料中感染了所述西瓜潜隐病毒;
所述表征是通过对所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳实现的;
所述PCR扩增采用的温度程序为:
(1)50℃反应30min;
(2)94℃反应2min;
(3)循环反应;
(4)72℃反应10min;
所述循环反应步骤为:94℃反应30s;55-56℃反应30s;72℃反应35s,循环30次。
12.一种检测待测病毒是否为西瓜潜隐病毒的方法,所述方法包括:
c1、采用权利要求1所述的引物对对所述待测病毒样本的核酸进行PCR扩增;
c2、根据所述扩增的产物判断所述待测病毒是否感染西瓜潜隐病毒。
13.如权利要求12所述的方法,其特征在于,所述待测病毒样本的核酸为所述待测病毒样本的总RNA。
14.如权利要求12所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增为RT-PCR扩增。
15.如权利要求12所述的方法,其特征在于,所述确定的步骤为:表征所述扩增产物中的DNA片段,当所述扩增产物中没有588bp的DNA片段时,判定所述待测病毒样本不是所述西瓜潜隐病毒;当所述扩增产物中含有588bp的DNA片段时,判定所述待测病毒样本是所述西瓜潜隐病毒;
所述表征是通过对所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳实现的;
所述PCR扩增采用的温度程序为:
(1)50℃反应30min;
(2)94℃反应2min;
(3)循环反应;
(4)72℃反应10min;
所述循环反应步骤为:94℃反应30s;55-56℃反应30s;72℃反应35s,循环30次。
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