[发明专利]基于基因检测判断肝癌药物敏感性和远期预后的预测工具及其应用

权利要求书

1.一种基因检测试剂在制备判断患者对肝癌药物索拉非尼敏感性试剂盒中的应用，其中所述基因检测试剂为测量LDHA基因、STC2基因、GPC1基因、TKTL1基因、SLC2A1基因、SRD5A3基因、PLOD2基因、G6PD基因、HMMR基因、HOMER1 基因、RARS1基因、GOT2基因、CENPA基因和SLC2A2基因表达量的试剂。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，试剂为与所述基因特异性结合的引物或探针。

3.一种基因检测试剂在制备肝癌患者远期预后预测试剂盒中的应用，其中所述基因检测试剂为测量LDHA基因、STC2基因、GPC1基因、TKTL1基因、SLC2A1基因、SRD5A3基因、PLOD2基因、G6PD基因、HMMR基因、HOMER1 基因、RARS1基因、GOT2基因、CENPA基因和SLC2A2基因表达量的试剂。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，试剂为与所述基因特异性结合的引物或探针。

5.一种构建预测肝癌患者对索拉菲尼敏感性和远期预后的预测工具的方法，其特征在于，具体为：

（1）通过使用单因素Cox回归模型统计筛选TCGA数据中与肝癌预后相关有氧糖酵解通路基因；

（2）在此基础上采用LASSO回归分析简化预后相关基因，建立基于有氧糖酵解通路基因的预测工具，简称有氧糖酵解指数；有氧糖酵解指数=LDHA基因表达量*0.163+STC2基因表达量*0.004+GPC1基因表达量*0.034+TKTL1基因表达量*0.0001+SLC2A1基因表达量*0.014+SRD5A3基因表达量*0.032+PLOD2基因表达量*0.070+G6PD基因表达量*0.083+HMMR基因表达量*0.040+HOMER1基因表达量*0.001+RARS1基因表达量*0.132-GOT2基因表达量*0.146+CENPA基因表达量*0.053-SLC2A2基因表达量*0.001；

其中，基因表达量的检测技术包括：二代RNA测序或三代RNA测序或基因芯片技术。