[发明专利]一种沉默长非编码RNA表达的方法及其应用在审
申请号: | 202110086360.8 | 申请日: | 2021-01-22 |
公开(公告)号: | CN114807126A | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 张雅鸥;张世宽;王松茂 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳国际研究生院 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/85;C12N15/55;C12N15/87;C12N9/22 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张立娜 |
地址: | 518055 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 沉默 编码 rna 表达 方法 及其 应用 | ||
1.用于在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA表达的成对sgRNA,分别记作sgRNA-1和sgRNA-2;所述sgRNA-1靶向靶序列1,所述靶序列1为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中任一内含子的BPS位点上游的序列;所述sgRNA-2靶向靶序列2,所述靶序列2为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中同一内含子的3’SS位点下游的序列。
2.根据权利要求1所述的成对sgRNA,其特征在于:所述靶序列1为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中任一内含子的BPS位点上游500-50bp的序列;所述靶序列2为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中同一内含子的3’SS位点下游75-500bp的序列。
3.如下任一生物材料:
P1、能够转录得到权利要求1或2所述成对sgRNA的DNA分子;
P2、含有P1中所述DNA分子的表达构建体;
P3、含有P2中所述表达构建体的重组菌;
P4、含有P2中所述表达构建体的重组细胞。
4.用于在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA表达的成套产品,为如下任一:
Q1、由i)特定核酸酶或表达构建体1,和ii)权利要求1或2中所述sgRNA-1或表达构建体2,和iii)权利要求1或2中所述sgRNA-2或表达构建体3组成;
Q2、由i)特定核酸酶或表达构建体1,和ii)表达构建体4组成;
Q3、由i)表达构建体5,和ii)所述sgRNA-2或表达构建体3组成;
Q4、由i)表达构建体6,和ii)所述sgRNA-1或表达构建体2组成;
Q5、表达构建体7;
所述表达构建体1为能够表达所述特定核酸酶的表达构建体;
所述表达构建体2为能够同时表达所述sgRNA-1的表达构建体;
所述表达构建体3为能够表达所述sgRNA-2的表达构建体;
所述表达构建体4为能够表达所述sgRNA-1和所述sgRNA-2的表达构建体;
所述表达构建体5为能够同时表达所述特定核酸酶和所述sgRNA-1的表达构建体;
所述表达构建体6为能够同时表达所述特定核酸酶和所述sgRNA-2的表达构建体;
所述表达构建体7为能够同时表达所述特定核酸酶和所述sgRNA-1和所述sgRNA-2的表达构建体;
所述特定核酸酶为能够识别并切割所述sgRNA-1和所述sgRNA-2的靶序列的任意核酸酶。
5.根据权利要求4所述的成套产品,其特征在于:所述特定核酸酶为CRISPR核酸酶;
进一步地,所述特定核酸酶为Cas9核酸酶。
6.权利要求1或2所述的成对sgRNA或权利要求3所述的生物材料或权利要求4或5所述的成套产品的用途,为用于在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA的表达。
7.一种在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA表达的方法,是通过将真核靶细胞基因组中表达目的长非编码RNA的序列中任一内含子的BPS位点和3’SS位点以及这两个位点之间的部分敲除或替换为其他序列,从而实现所述目的长非编码RNA的表达沉默。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:向所述真核靶细胞中导入权利要求4或5所述的成套产品。
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