[发明专利]一种沉默长非编码RNA表达的方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202110086360.8 申请日: 2021-01-22
公开(公告)号: CN114807126A 公开(公告)日: 2022-07-29
发明(设计)人: 张雅鸥;张世宽;王松茂 申请(专利权)人: 清华大学深圳国际研究生院
主分类号: C12N15/113 分类号: C12N15/113;C12N15/85;C12N15/55;C12N15/87;C12N9/22
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 张立娜
地址: 518055 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 沉默 编码 rna 表达 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.用于在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA表达的成对sgRNA,分别记作sgRNA-1和sgRNA-2;所述sgRNA-1靶向靶序列1,所述靶序列1为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中任一内含子的BPS位点上游的序列;所述sgRNA-2靶向靶序列2,所述靶序列2为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中同一内含子的3’SS位点下游的序列。

2.根据权利要求1所述的成对sgRNA,其特征在于:所述靶序列1为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中任一内含子的BPS位点上游500-50bp的序列;所述靶序列2为表达所述长链非编码RNA的基因组序列中同一内含子的3’SS位点下游75-500bp的序列。

3.如下任一生物材料:

P1、能够转录得到权利要求1或2所述成对sgRNA的DNA分子;

P2、含有P1中所述DNA分子的表达构建体;

P3、含有P2中所述表达构建体的重组菌;

P4、含有P2中所述表达构建体的重组细胞。

4.用于在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA表达的成套产品,为如下任一:

Q1、由i)特定核酸酶或表达构建体1,和ii)权利要求1或2中所述sgRNA-1或表达构建体2,和iii)权利要求1或2中所述sgRNA-2或表达构建体3组成;

Q2、由i)特定核酸酶或表达构建体1,和ii)表达构建体4组成;

Q3、由i)表达构建体5,和ii)所述sgRNA-2或表达构建体3组成;

Q4、由i)表达构建体6,和ii)所述sgRNA-1或表达构建体2组成;

Q5、表达构建体7;

所述表达构建体1为能够表达所述特定核酸酶的表达构建体;

所述表达构建体2为能够同时表达所述sgRNA-1的表达构建体;

所述表达构建体3为能够表达所述sgRNA-2的表达构建体;

所述表达构建体4为能够表达所述sgRNA-1和所述sgRNA-2的表达构建体;

所述表达构建体5为能够同时表达所述特定核酸酶和所述sgRNA-1的表达构建体;

所述表达构建体6为能够同时表达所述特定核酸酶和所述sgRNA-2的表达构建体;

所述表达构建体7为能够同时表达所述特定核酸酶和所述sgRNA-1和所述sgRNA-2的表达构建体;

所述特定核酸酶为能够识别并切割所述sgRNA-1和所述sgRNA-2的靶序列的任意核酸酶。

5.根据权利要求4所述的成套产品,其特征在于:所述特定核酸酶为CRISPR核酸酶;

进一步地,所述特定核酸酶为Cas9核酸酶。

6.权利要求1或2所述的成对sgRNA或权利要求3所述的生物材料或权利要求4或5所述的成套产品的用途,为用于在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA的表达。

7.一种在真核细胞基因组中沉默长非编码RNA表达的方法,是通过将真核靶细胞基因组中表达目的长非编码RNA的序列中任一内含子的BPS位点和3’SS位点以及这两个位点之间的部分敲除或替换为其他序列,从而实现所述目的长非编码RNA的表达沉默。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:向所述真核靶细胞中导入权利要求4或5所述的成套产品。

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