[发明专利]一种HLA分型方法和系统在审
| 申请号： | 202110111896.0 | 申请日： | 2021-01-27 |
| 公开（公告）号： | CN114807338A | 公开（公告）日： | 2022-07-29 |
| 发明（设计）人： | 王志敏;虞修简;黄薇;郑华军 | 申请（专利权）人： | 上海产业技术研究院;上海人类基因组研究中心 |
| 主分类号： | C12Q1/6881 | 分类号： | C12Q1/6881;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人： | 陶启长;韦东 |
| 地址： | 201203 上*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 hla 方法 系统 | ||
本发明涉及对iPS细胞进行HLA分型的方法和系统，包括对iPS细胞及其分化细胞进行HLA基因检测。本发明还涉及所述方法中所用的试剂。
技术领域
本发明涉及分子生物学领域，具体而言，本发明涉及对iPS细胞及其分化细胞进行HLA分型的方法和系统。
背景技术
人类白细胞抗原，即HLA(humanleukocyteantigen)，是调控人体特异性免疫应答和决定疾病易感性个体差异的主要基因系统，与同种异体器官移植的排斥反应密切相关。
HLA系统在抗原识别、抗原递呈、免疫应答与调控、破坏外来抗原靶细胞等方面发挥重要的作用，是引起免疫排斥反应的主要物质基础。移植物细胞表面I类和II类抗原都是强移植抗原，体液免疫和细胞免疫都参与了对移植物的排斥反应，无论是异基因器官、组织或细胞的移植，供受体间HLA相配是成功的关键。
通过建设覆盖大部分人群HLA分型的人iPS库是干细胞疗法上游建设的重要环节。通过对基因组测序可获取某一样品的HLA分型情况。现有技术中获得的人iPS库尚存在分型不准确的现象，影响配型结果，可能会导致免疫排斥反应。本领域仍需要改进的iPS细胞HLA基因分型方法，以便对HLA基因进行准确分型的分型。
发明内容
发明人发现，仅对体细胞及iPS细胞进行HLA测序，并将其作为配型依据可能存在隐藏风险。
本发明第一方面提供引物，所述引物用于扩增哺乳动物细胞DNA，所述引物的扩增产物包含选自以下的一个或多个片段：
由SEQ ID NO:1和2作为引物扩增的HLA-A基因的片段，
由SEQ ID NO:3和4作为引物扩增的HLA-B基因的片段，
由SEQ ID NO:5和6作为引物扩增的HLA-C基因的片段，
由SEQ ID NO:7和8作为引物扩增的HLA-DPA基因的片段，
由SEQ ID NO:9和10作为引物扩增的HLA-DPB基因的片段，
由SEQ ID NO:11和12作为引物扩增的HLA-DQA基因的片段，
由SEQ ID NO:13和14作为引物扩增的HLA-DQB基因的片段，
由SEQ ID NO:15和16作为引物扩增的HLA-DRB基因的片段。
在一个或多个实施方案中，所述引物是在严谨条件下与选自以下的一个或多个片段杂交的序列：
由SEQ ID NO:1和2作为引物扩增的HLA-A基因的片段，
由SEQ ID NO:3和4作为引物扩增的HLA-B基因的片段，
由SEQ ID NO:5和6作为引物扩增的HLA-C基因的片段，
由SEQ ID NO:7和8作为引物扩增的HLA-DPA基因的片段，
由SEQ ID NO:9和10作为引物扩增的HLA-DPB基因的片段，
由SEQ ID NO:11和12作为引物扩增的HLA-DQA基因的片段，
由SEQ ID NO:13和14作为引物扩增的HLA-DQB基因的片段，
由SEQ ID NO:15和16作为引物扩增的HLA-DRB基因的片段。
在一个或多个实施方案中，所述引物选自：
(1)SEQ ID NO:1-16中任意所示的序列，
(2)与(1)有至少90％相同性的序列；和
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