[发明专利]54个Y染色体基因座的荧光复合扩增体系、试剂盒及应用在审

专利信息
申请号: 202110115836.6 申请日: 2021-01-28
公开(公告)号: CN112662786A 公开(公告)日: 2021-04-16
发明(设计)人: 于在亮;李思思;郭丹;高运通;钱勇 申请(专利权)人: 苏州阅微基因技术有限公司
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 刘妍妍
地址: 215011 江苏省苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 54 染色体 基因 荧光 复合 扩增 体系 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.54个Y染色体基因座的荧光复合扩增体系,其特征在于,该复合扩增体系包括49对引物,可同时扩增54个位点,包括53个Y染色体STR基因座和1个Y-Indel;其中53个Y染色体STR基因座分别为:DYS393、DYS570、DYS19、DYS392、DYS549、Y-GATA-H4、DYS444、DYS593、DYS617、DYS388、DYS520、DYS460、DYS458、DYS481、DYS635、DYS438、DYS447、DYS443、DYS522、DYS622、DYS459a/b、DYS389I、DYS390、DYS389II、DYS448、DYS533、DYS449、DYS531、DYS510、DYS713、DYS391、DYS439、DYS437、DYS385a/b、DYS643、DYS518、DYS508、DYS596、Y-GATA-A10、DYS576、DYF404S1、DYF387S1、DYS627、DYS527a/b、DYS557、DYS645、DYS456、DYS552;

53个Y染色体STR基因座和1个Y-Indel的特异性引物如下所述:

2.根据权利要求1所述的荧光复合扩增体系,其特征在于:所述特异性引物的浓度分别为:

3.根据权利要求1所述的扩增体系,其特征在于:每对引物对的其中一条引物的5’端标记有不同的荧光素,形成五种不同颜色的荧光标记,相同的荧光标记视为一组,五组组合分别为:

Y-Indel、DYS393、DYS570、DYS19、DYS392、DYS549、Y-GATA-H4、DYS444、DYS593、DYS617、DYS388、DYS520为第一组;

DYS460、DYS458、DYS481、DYS635、DYS438、DYS447、DYS443、DYS522、DYS622为第二组;

DYS459a/b、DYS389I、DYS390、DYS389II、DYS448、DYS533、DYS449、DYS531、DYS510、DYS713为第三组;

DYS391、DYS439、DYS437、DYS385a/b、DYS643、DYS518、DYS508、DYS596、Y-GATA-A10为第四组;

DYS576、DYF404S1、DYF387S1、DYS627、DYS527a/b、DYS557、DYS645、DYS456、DYS552为第五组。

4.根据权利要3所述的荧光复合扩增体系,其特征在于:所述第一组采用FAM标记,第二组采用HEX标记,第三组采用L552标记,第四组采用LR600标记,第五组采用TET-592标记。

5.根据权利要求3或4所述的荧光复合扩增体系,其特征在于:还包括一组分子量内标,所述的分子量内标产物荧光采用的是AF633标记,片段大小分别为70、80、100、120、140、160、180、200、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500、525、550、575、600、625、650。

6.根据权利要求1所述的荧光复合扩增体系,其特征在于:包含一款PCR预混液,2.5mM硫酸铵,50mM氯化钾,0.3mg/ml BSA,6.00%DMSO,100mM-120mM甜菜碱,35mM pH 8.0的Tris-HCl,1.5mM-2mM镁离子,0.2mM dNTP以及1U TaqDNA聚合酶;

所述扩增体系扩增时的反应条件为:

第1步:95℃变性10分钟,第2步:94℃变性20秒,第3步59℃退火90秒,重复2至3步28次,第4步:60℃延伸30-60分钟。

7.根据权利要求1所述的荧光复合扩增体系,其特征在于:所述的扩增体系还包括等位基因分型标准物。

8.一种试剂盒,其特征在于:包括如权利要求1-8任一项所述的荧光复合扩增体系。

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