[发明专利]一种用于原发性肝细胞癌早期诊断的生物标志物及其检测试剂和应用

权利要求书

1.一种生物标志物在构建原发性肝细胞癌早期诊断的预测模型中的应用，其特征在于，所述生物标志物由以下菌属组成：布劳特氏菌属(Blautia)、大肠埃希菌-志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)、扭链瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus group)、活泼瘤胃球菌(Ruminococcus torques group)、链球菌属(Streptococcus)、霍氏真杆菌(Eubacteriumhallii group)、挑剔真杆菌(Eubacterium eligens group)、多尔氏菌属(Dorea)、拟杆菌属(Bacteroides)、普雷沃氏菌属9(Prevotella 9)、毛螺菌属(Lachnospira)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、巨单胞菌属(Megamonas)和Lachnospiraceae NK4A136 group。

2.根据权利要求1所述应用，其特征在于，所述布劳特氏菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示的Blautia hydrogenotrophica、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示的Blautia sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示的Blautia faecis、16SrRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示的uncultured Blautia sp.、16S rRNA核酸序列如SEQID NO:7所示的uncultured bacteriumBlautia sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示的Blautia obeum、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示的Blautia wexlerae；

所述大肠埃希菌-志贺氏菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的Escherichia coli、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的Shigella sonnei；

所述活泼瘤胃球菌包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示的unculturedbacterium[Ruminococcus]torques、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示的uncultured organism[Ruminococcus]torques、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:13所示的Ruminococcus torques；

所述扭链瘤胃球菌包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:19所示的unculturedbacterium[Ruminococcus]gnavus、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:20所示的[Ruminococcus]gnavus；

所述链球菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:14所示的Streptococcusanginosus、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示的Streptococcus equinus、16SrRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示的Streptococcus gallolyticus、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:17所示的Streptococcus thermophilus、16S rRNA核苷酸序列如SEQ IDNO:18所示的Streptococcus salivarius；

所述霍氏真杆菌包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:21所示的unculturedbacterium[Eubacterium]hallii、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:22所示的unculturedorganism[Eubacterium]hallii、16SrRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:23所示的[Eubacterium]hallii；

所述挑剔真杆菌包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:41所示的[Eubacterium]eligens；

所述多尔氏菌属(Dorea)包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:24所示的Doreaformicigenerans、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:25所示的Dorea longicatena；

所述拟杆菌属(Bacteroides)包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:26所示的Bacteroides dorei、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:27所示的Bacteroideseggerthii、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:28所示的Bacteroidesfragilis、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:29所示的Bacteroides massiliensis、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:30所示的Bacteroides ovatus、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:31所示的Bacteroides stercoris、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:32所示的Bacteroidesthetaiotaomicron、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:33所示的Bacteroides uniformis、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:34所示的unculturedBacteroides sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:35所示的Bacteroides vulgatus；

所述普雷沃氏菌属9包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:36所示的unculturedbacterium Prevotella 9sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:37所示的unculturedorganismPrevotella 9sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:38所示的Prevotellacopri；

所述毛螺菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:39所示的unculturedbacteriumLachnospira sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:40所示的Lachnospira sp.；

所述Lachnospiraceae NK4A136 group包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:49所示的UnculturedLachnospiraceae bacterium、16SrRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:50所示的Lachnospiraceae bacterium；

所述粪杆菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:42所示的unculturedbacteriumFaecalibacterium sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:43所示的Faecalibacteriumprausnitzii；

所述考拉杆菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:44所示的gutmetagenomePhascolarctobacterium sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:45所示的unculturedbacterium Phascolarctobacterium sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:46所示的Phascolarctobacteriumfaecium；

所述巨单胞菌属包括16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:47所示的unculturedbacterium Megamonas sp.、16S rRNA核苷酸序列如SEQ ID NO:48所示的Megamonasfuniformis。