[发明专利]一种用于原发性肝细胞癌早期诊断的生物标志物及其检测试剂和应用有效
申请号: | 202110144203.8 | 申请日: | 2021-02-02 |
公开(公告)号: | CN112899368B | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
发明(设计)人: | 彭涛;陈晓东;王向坤;庞世福;洪志帆 | 申请(专利权)人: | 广西医科大学第一附属医院;广西爱生生命科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/689;C12N15/11;C12Q1/10;C12Q1/14;G16H50/20;G16B40/00;C12R1/19;C12R1/46;C12R1/01 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 薛红凡 |
地址: | 530021 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 原发性 肝细胞 早期 诊断 生物 标志 及其 检测 试剂 应用 | ||
本发明提供了一种用于原发性肝细胞癌早期诊断的生物标志物及其检测试剂和应用,属于肝癌诊断技术领域。本发明通过16S rRNA测序的方法对检测对象的粪便标本提取细菌DNA后进行Illumina Miseq测序,鉴定出肝癌早期和健康对照的肠道生物标志物,并通过生物标志物建立特异性鉴定肝癌早期和健康人群样本的随机森林模型,绘制学习曲线评估模型的拟合情况,通过接受者操作特性曲线评估模型效果;预测模型的曲线下面积为0.95,测试结果的精度为0.97,召回率为1.0,特异度为0.98。由此可见,本发明的生物标志物、构建的随机森林训练模型和检测方法对肝癌早期诊断具有良好的市场前景。
技术领域
本发明属于肝癌诊断技术领域,具体涉及一种用于原发性肝细胞癌早期诊断的生物标志物及其检测试剂和应用。
背景技术
肝癌是世界上第6种最常见的恶性肿瘤。肝癌的病因较多,最常见的是乙肝病毒、丙肝病毒的持续感染;还有酒精和药物因素引起的肝硬化,肝硬化可以慢慢转变为肝癌;另外,肝癌和遗传以及精神因素也有关系。
肝癌(尤其是原发性肝癌)的临床病象极不典型,其症状一般不明显,特别是在病程早期,约70%左右的患者在肝癌肿瘤5cm以下时无明显症状。症状一旦出现,说明肿瘤已经较大,通常在数周内即呈现恶病质,往往在几个月至1年内即衰竭死亡。大部分肝癌患者在出现症状时已经是晚期,治愈率较低。
目前,用于肝癌诊断的生物标志物主要为甲胎蛋白,当血清中甲胎蛋白含量大于400μg/L,并保持持续性升高时(且能排除妊娠、活动性肝病、生殖腺胚胎源性肿瘤等),即可考虑进行肝癌的后续检测。但是,临床上约30%肝癌患者的甲胎蛋白不升高,由此可见,甲胎蛋白的诊断特异性不高,容易延误患者的治疗时机。因此,探索开发新思路用于肝癌早期诊断的方法具有深远的意义。
发明内容
有鉴于此,本发明的目的在于提供一种用于原发性肝细胞癌早期诊断的生物标志物,对原发性肝细胞癌早期诊断具有较高的特异性。
本发明的目的还在于提供一种原发性肝细胞癌早期诊断生物标志物的检测试剂及其应用,实现肝癌早期的筛查和诊断。
本发明的目的还在于提供一种肝癌早期诊断用预测模型的构建方法,采用构建的预测模型进行诊断具有较高的精度、召回率和特异度。
本发明提供了一种用于原发性肝细胞癌早期诊断的生物标志物,包括以下菌属:
布劳特氏菌属、大肠埃希菌-志贺氏菌属、胃球菌属、链球菌属、真杆菌属、多尔氏菌属、拟杆菌属、普雷沃氏菌属9、毛螺菌属、粪杆菌属、考拉杆菌属、巨单胞菌属(Megamonas)、Lachnospiraceae NK4A136 group。
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