[发明专利]一种真姬菇HM21菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用有效

专利信息
申请号: 202110166710.1 申请日: 2021-02-04
公开(公告)号: CN112795687B 公开(公告)日: 2023-02-28
发明(设计)人: 龚明;李燕;吴莹莹;陈洪雨;汪滢;唐利华 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 代理人: 王江南
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 真姬菇 hm21 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种真姬菇HM21菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成,其对应的6对引物的具体序列如下:

HMSSR3正向引物:GCGAAACCATATTCATGCGT;

反向引物:ATTACTTGTCGTCGGCAGGA;

HMSSR5正向引物:CACACCTTACGAGGTGAGCA;

反向引物:TGTTTGATGTTAGCCGAACG;

HMSSR11正向引物:GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC;

反向引物:ATGAACCAGACCAAAGACCG;

HMSSR18正向引物:GAGGATTGAAGGGACTGTCG;

反向引物:CCTCATCCTCCGACTCTACG;

HMSSR47正向引物:TCTCATGGAACGACCTGGAG;

反向引物:TCCAAATCCAGACTCTTCGC;

HMSSR59正向引物:CACTGTTCCAGAGTGGGACC;

反向引物:AGGGCCTTTTCAGAGACGAT;

相应带型编号组合为:2/9/(2+3)/(3+4)/(3+6)/(1+6);

其中,引物HMSSR3对应的带型编号为2,其对应的等位基因片段的条带大小为141~141.99bp;

引物HMSSR5对应的带型编号为9,其对应的等位基因片段的条带大小为207~207.99bp;

引物HMSSR11对应的带型编号为2+3,其中编号2对应的等位基因片段的条带大小为266~266.99bp,编号3对应的等位基因片段的条带大小为273~273.99bp;

引物HMSSR18对应的带型编号为3+4,其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为257~257.99bp,编号4对应的等位基因片段的条带大小为262~262.99bp;

引物HMSSR47对应的带型编号为3+6,其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为144~144.99bp,编号6对应的等位基因片段的条带大小为155~155.99bp;

引物HMSSR59对应的带型编号为1+6,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为144~144.99bp,编号6对应的等位基因片段的条带大小为174~174.99bp; 所述真姬菇HM21菌种的保藏编号为GDMCCNo:61414。

2.权利要求1所述的真姬菇HM21菌种的SSR标记的指纹图谱的应用,其特征在于:所述真姬菇HM21菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇HM21菌种的特异等位变异,和/或鉴定真姬菇HM21菌种的特异性。

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