[发明专利]一种真姬菇HM21菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用有效
申请号: | 202110166710.1 | 申请日: | 2021-02-04 |
公开(公告)号: | CN112795687B | 公开(公告)日: | 2023-02-28 |
发明(设计)人: | 龚明;李燕;吴莹莹;陈洪雨;汪滢;唐利华 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人: | 王江南 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 真姬菇 hm21 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种真姬菇HM21菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成,其对应的6对引物的具体序列如下:
HMSSR3正向引物:GCGAAACCATATTCATGCGT;
反向引物:ATTACTTGTCGTCGGCAGGA;
HMSSR5正向引物:CACACCTTACGAGGTGAGCA;
反向引物:TGTTTGATGTTAGCCGAACG;
HMSSR11正向引物:GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC;
反向引物:ATGAACCAGACCAAAGACCG;
HMSSR18正向引物:GAGGATTGAAGGGACTGTCG;
反向引物:CCTCATCCTCCGACTCTACG;
HMSSR47正向引物:TCTCATGGAACGACCTGGAG;
反向引物:TCCAAATCCAGACTCTTCGC;
HMSSR59正向引物:CACTGTTCCAGAGTGGGACC;
反向引物:AGGGCCTTTTCAGAGACGAT;
相应带型编号组合为:2/9/(2+3)/(3+4)/(3+6)/(1+6);
其中,引物HMSSR3对应的带型编号为2,其对应的等位基因片段的条带大小为141~141.99bp;
引物HMSSR5对应的带型编号为9,其对应的等位基因片段的条带大小为207~207.99bp;
引物HMSSR11对应的带型编号为2+3,其中编号2对应的等位基因片段的条带大小为266~266.99bp,编号3对应的等位基因片段的条带大小为273~273.99bp;
引物HMSSR18对应的带型编号为3+4,其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为257~257.99bp,编号4对应的等位基因片段的条带大小为262~262.99bp;
引物HMSSR47对应的带型编号为3+6,其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为144~144.99bp,编号6对应的等位基因片段的条带大小为155~155.99bp;
引物HMSSR59对应的带型编号为1+6,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为144~144.99bp,编号6对应的等位基因片段的条带大小为174~174.99bp; 所述真姬菇HM21菌种的保藏编号为GDMCCNo:61414。
2.权利要求1所述的真姬菇HM21菌种的SSR标记的指纹图谱的应用,其特征在于:所述真姬菇HM21菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇HM21菌种的特异等位变异,和/或鉴定真姬菇HM21菌种的特异性。
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