[发明专利]一种sgRNA文库构建方法在审

专利信息
申请号: 202110213880.0 申请日: 2021-02-25
公开(公告)号: CN112981544A 公开(公告)日: 2021-06-18
发明(设计)人: 喻明军;崔康乐;王维坤;骆晓雯;纪世春 申请(专利权)人: 通用生物系统(安徽)有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12N15/10
代理公司: 合肥正则元起专利代理事务所(普通合伙) 34160 代理人: 刘生昕
地址: 239000 安徽省滁*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 一种 sgrna 文库 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种sgRNA文库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:

第一步、sgRNA设计;

第二步、上下游引物合成;

第三步、构建sgRNA文库。

2.根据权利要求1所述的一种sgRNA文库构建方法,其特征在于,sgRNA设计具体操作为针对需编辑的基因设计sgRNA,每个基因通常设计3条sgRNA,每条sgRNA 20bp,20个碱基作为靶基因的特异性识别序列。

3.根据权利要求1所述的一种sgRNA文库构建方法,其特征在于,上下游引物合成具体步骤为上游引物50-80bp,从5’端至3’端依次为与载体的5’端20-40bp同源序列,20bpsgRNA,15-20b与下游引物3’端互补序列;下游引物为通用引物,35-60bp,从5’端至3’端依次为与载体的5’端20-40bp同源序列,15-20b与上游引物3’端互补序列。

4.根据权利要求1所述的一种sgRNA文库构建方法,其特征在于,构建sgRNA文库具体步骤如下:

首先将第二步中N条上游引物等量混合均匀,再与下游引物一起混合均匀,最终浓度为10μm;将其作为PCR扩增的引物和模板,添加dNTP、PCR反应Buffer、高保真DNA聚合酶等,反应体系为10-100uL,进行PCR扩增;PCR产物的大小在60-140bp之间,采用乙醇/异丙醇沉淀的方式回收pcr产物;

其次以BsmBI酶切商品化质粒lentiCRISPR v2,并与纯化后的pcr产物通过Gibson重组的方式进行连接;转化至感受态细胞后37℃下过夜培养,对慢病毒载体lentiCRISPR v2优选重组酶recA13突变型菌株Stbl 3,为提高转化效率,宜选择电转感受态;

然后挑选单克隆,摇菌抽质粒,测序验证;

最后对测序结果进行分析统计。

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