[发明专利]无同源性、多个长片段、高效零背景组装方法在审

专利信息
申请号: 202110220459.2 申请日: 2021-02-26
公开(公告)号: CN112921050A 公开(公告)日: 2021-06-08
发明(设计)人: 喻明军;崔康乐;王维坤;骆晓雯;纪世春 申请(专利权)人: 通用生物系统(安徽)有限公司
主分类号: C12N15/81 分类号: C12N15/81;C12N15/70;C12N15/66
代理公司: 合肥正则元起专利代理事务所(普通合伙) 34160 代理人: 刘生昕
地址: 239000 安徽省滁*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 同源性 多个长 片段 高效 背景 组装 方法
【说明书】:

发明公开了无同源性、多个长片段、高效零背景组方法,包括以下步骤:先在整个环化质粒限制性内切酶Not I位点唯一处,添加一个B片段Yesator i,同时保证B片段左右有且刚好只两个Not I酶切位点,示例无同源性的A、B片段之间设计两条Pr imer 1/2引物,无同源性的B、C片段之间设计两条Pr imer 3/4引物以引物作为两个片段之间连接的桥梁;将所有片段共7个ABCDEFG,同每个片段接头处的一对引物共7对pr imer1‑14,一同转入酵母感受态细胞震荡培养两天;第四步、提取培养两天的酵母质粒;最后经过扩增、检测即得,本发明提供一种无同源性、多个长片段、高效零背景组方法,经过酵母组装、大肠杆菌筛选,即完成零背景克隆,无空载体产出,且相较于传统克隆方式节约大量时间。

技术领域

本发明属于生物工程技术领域,具体的,涉及无同源性、多个长片段、高效零背景组装方法。

背景技术

目前,由于基因片段之间无同源性,通常无法一次性将6个片段按次序依次连接成环,常规基因合成方法都是分段依次多步骤完成,所需要的轮次经理的步骤较多。

发明内容

本发明的目的在于提供一种无同源性、多个长片段、高效零背景组方法装方法。

本发明需要解决的技术问题为:

现有技术中,由于基因片段之间无同源性,通常无法一次性将6个片段按次序依次连接成环,常规基因合成方法都是分段依次多步骤完成,所需要的轮次经理的步骤较多。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现:

无同源性、多个长片段、高效零背景组方法,包括以下步骤:

第一步、在整个环化质粒限制性内切酶NotI位点唯一处,添加一个B片段Yesatori,同时保证B片段左右有且刚好只两个NotI酶切位点,以便后续NotI单切自连去除B片段;

第二步、示例无同源性的A、B片段之间设计两条Primer 1/2引物,无同源性的B、C片段之间设计两条Primer 3/4引物以引物作为两个片段之间连接的桥梁,其它片段之间设计依次类推;

第三步、将所有片段共7个ABCDEFG,这些片段可以通过PCR扩增或者质粒酶切得到,同每个片段接头处的一对引物共7对primer1-14,一同转入酵母感受态细胞,使用Sc-Trp缺色氨酸液体培养基进行30℃震荡培养两天;

第四步、提取培养两天的酵母质粒;

第五步、提取的酵母质粒转化大肠杆菌扩增;

第六步、PCR菌检、提取大肠杆菌质粒酶切验证,测序验证;

第七步、NotI单切正确的大肠杆菌质粒,凝胶电泳回收,去除B片段,T4 DNA连接酶自连处理后导入大肠杆菌37℃培养筛选,得到去除多余的B片段质粒,最后再抽提大肠杆菌中的质粒,测序验证以及酶切验证质粒的正确性。

进一步地,所述提取酵母质粒的具体操作步骤如下:

步骤S1、取1-5mL酵母培养物,于12000rpm转速下离心1-3min,吸去上清;

步骤S2、酵母细胞壁的破除:向酵母菌体中加入470μL山梨醇Buffer,充分悬浮菌体,加入25μL酵母破壁霉和5μLβ-疏基乙醇,混匀后于30℃下处理1-2h,期间可颠倒离心管3-5次,然后在转速12000r/min条件下离心1-3min,弃去上清,收集沉淀,向沉淀中加入250μLYP1充分悬浮沉淀,吸取上清;

步骤S3、向离心管中加入350μL YP3,立即温和地上下翻转6-8次,混匀后,于转速12000r/min下离心10min,用移液器小心地将上清转移至另一个干净的离心管中;

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