[发明专利]一种用于预测低果糖桃的SNP分子标记及检测方法有效
申请号: | 202110278213.0 | 申请日: | 2021-03-15 |
公开(公告)号: | CN113151541B | 公开(公告)日: | 2022-04-26 |
发明(设计)人: | 徐摇光;谢华;于洋;官健涛 | 申请(专利权)人: | 北京农业生物技术研究中心 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京商专永信知识产权代理事务所(普通合伙) 11400 | 代理人: | 欧阳石文 |
地址: | 100097 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 预测 果糖 snp 分子 标记 检测 方法 | ||
1.一种通过检测SNP分子标记预测桃果糖含量水平的方法,其特征在于:所述分子SNP标记来自桃基因组1号染色体11,910,990 bp位点,通过确定其为GG基因型或CG基因型时,则桃果糖含量水平为低果糖;当其为CC基因型时,则桃果糖含量水平不为低果糖;
采用KASP检测待测桃基因组中1号染色体11,910,990 bp位点的基因型,所述KASP检测所用的引物组合包括上游两条正向引物,以及下游一条反向引物为P3引物,其中各引物序列如下:
P1:GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAAGTGGTATATCACATTCTAGGTTTATTC;
P2:GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAGTGGTATATCACATTCTAGGTTTATTG;
P3:GGTAAGTCTCTAGTTTGACTGAGTTGC。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,将所述方法用于桃果糖的早期预测,或者杂交亲本的选择。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,
P1引物连接荧光标记VIC和P2引物连接荧光标记FAM。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述引物用无菌水溶解并稀释至100μM,按照P1:P2:P3:水=24:24:48:100比例混合形成引物混合物备用。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所用的PCR反应体系如下:
PCR反应体系以4μL计为:20 ng/μL的DNA样品 1 μL、4×引物混合物1 μL、DNA 聚合酶液 2μL;
PCR反应参数为:94 ℃10 min,然后94 ℃20 sec、61-55 ℃60 sec循环10次,每个循环下降0.6 ℃,再于94 ℃20 sec、55 ℃60 sec循环27次。
6.如权利要求1至5任一项所述的方法在桃品种培育中的应用,所述应用是指有目的的培育桃果糖含量水平的品种。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,是针对杂交苗进行检测,或用于杂交培育的亲本进行检测以选择适合目标培育品种的亲本。
8.如权利要求7所述的应用,其特征在于,以非低果糖为育种目标,选择桃品种的基因组1号染色体第11,910,990 bp为CC的个体;以低果糖为育种目标,选择桃树基因组1号染色体第11,910,990 bp为CG或GG的个体。
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