[发明专利]一种黄河鲤抗嗜水气单胞菌感染相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202110313764.6 | 申请日: | 2021-03-24 |
公开(公告)号: | CN112852978B | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
发明(设计)人: | 江炎亮;许建;赵紫霞;赵小鹏 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京酷爱智慧知识产权代理有限公司 11514 | 代理人: | 袁克来 |
地址: | 100141 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 黄河 鲤抗嗜 水气 单胞菌 感染 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.SNP分子标记在抗嗜水气单胞菌感染的黄河鲤选育中的应用;所述SNP分子标记包括Carp0366630、Carp0413293、Carp0795057、Carp1175625、Carp0745237、Carp0943001、Carp1277494和Carp1848978中的至少一种;
所述Carp0366630的物理位置位于LG9染色体的30,777,954bp,其抗病基因型为CC;
所述Carp0413293的物理位置位于LG10染色体的31,705,120bp,其抗病基因型为TC;
所述Carp0795057的物理位置位于LG20染色体的10,999,307bp,其抗病基因型为AA;
所述Carp1175625的物理位置位于LG31染色体的8,238,176bp,其抗病基因型为TT;
所述Carp0745237的物理位置位于LG18染色体的27,587,525bp,其易感基因型为CC;
所述Carp0943001的物理位置位于LG24染色体的21,135,602bp,其易感基因型为TT;
所述Carp1277494的物理位置位于LG34染色体的707,283bp,其易感基因型为TT;
所述Carp1848978的物理位置位于LG50染色体的13,748,395bp,其易感基因型为AA。
2.一种抗嗜水气单胞菌感染的黄河鲤的选育方法,其特征在于,包括如下步骤:
(a)提取黄河鲤样本DNA;
(b)对权利要求1中的SNP分子标记位点进行扩增;
(c)将扩增产物进行测序,并根据SNP所在位点的序列信息获得基因型;
(d)根据获得的基因型筛选抗嗜水气单胞菌感染的黄河鲤。
3.根据权利要求2所述的选育方法,其特征在于,所述步骤(b)中,扩增体系如下:
2×Es Taq MasterMix 20μl,样本DNA 2μl,浓度为10μM的上游引物1μl,浓度为10μM的下游引物1μl,无菌水16μl。
4.根据权利要求2所述的选育方法,其特征在于,所述步骤(b)中,PCR过程如下:
94℃4min变性,(94℃30s预热、60℃30s偶联、72℃45s延伸)×30个循环,72℃10min延伸;4℃保存。
5.根据权利要求2所述的选育方法,其特征在于,所述步骤(d)中,根据获得的基因型筛选抗嗜水气单胞菌感染的黄河鲤具体包括:
筛选具有抗病系SNP分子标记的个体和/或剔除具有易感系SNP分子标记的个体。
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