[发明专利]一种黄河鲤抗嗜水气单胞菌感染相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种黄河鲤抗嗜水气单胞菌感染相关的SNP分子标记及其应用，所述SNP分子标记包括Carp0366630、Carp0413293、Carp0795057、Carp1175625、Carp0745237、Carp0943001、Carp1277494和Carp1848978中的至少一种；本发明中SNP分子标记为8个，分别位于不同的染色体上，此8个SNP分子标记所在位点的所有基因型中，有4种基因型在抗病系个体中特有，有4种基因型在易感系个体中特有，借助本发明的SNP分子标记，通过PCR扩增的方法，针对SNP分子标记所在区域扩增并测序后，检测该位点的基因型，从而依据生产实际的需求来筛选出具有较强抗性的个体或者剔除抗性较弱的个体，大大缩短了抗病家系的选育时间。

技术领域

本发明涉及黄河鲤选育技术领域，具体涉及一种黄河鲤抗嗜水气单胞菌感染相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

黄河鲤是中国黄河流域长期自然形成的特有经济鱼类，同松江鲈鱼、兴凯湖鲌鱼、松花江鲑鱼并称为我国四大名鱼，自古以来被视为食之上品，以金鳞赤尾、体态优美、肉质细嫩鲜美而驰名。近年来由于高密度集约化的养殖条件，鲤受病害的威胁越来越严重。其中，嗜水气单胞菌是影响鲤鱼产业最严重的病原菌之一，是引发出血性败血症等疾病的主要致病菌。水产养殖中治疗嗜水气单胞菌病最常用的方法是使用诺氟沙星、四环素等抗生素。但是抗生素的长期使用不仅容易使病原菌产生耐药性，而且作为一种生态系统污染源，会对环境和水产品质量安全造成严重威胁。因此，培养出自身具备较强抗病能力的个体及家系，是水产养殖可持续性健康发展的重要手段之一。

目前黄河鲤抗病家系的培育主要采用传统的选育方法，首先挑选较为壮实的个体作为父母本进行繁育，培养出来的子代通过人工感染病原菌，将存活个体留作新一代父母本进行繁育，如此反复多代来获得抗病家系。黄河鲤性成熟周期较长，一般为2-3年，所以传统的选育方法耗时很长。而且，传统方法对优良性状的选育往往具有随机性。

发明内容

本发明的目的在于提供一种黄河鲤抗嗜水气单胞菌感染相关的SNP分子标记及其应用，本发明通过利用SNP分子标记能快速地筛选出具有较强抗病能力的黄河鲤，并用作亲本进行繁育培养出高品质的能一定程度上抵抗嗜水气单胞菌感染的家系，大大缩短抗病家系的选育时间。

为了实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：

本发明第一方面提供一种黄河鲤抗嗜水气单胞菌感染相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记包括Carp0366630、Carp0413293、Carp0795057、Carp1175625、Carp0745237、Carp0943001、Carp1277494和Carp1848978中的至少一种；

所述Carp0366630的物理位置位于LG9染色体的30,777,954bp，其抗病基因型为CC；

所述Carp0413293的物理位置位于LG10染色体的31,705,120bp，其抗病基因型为TC；

所述Carp0795057的物理位置位于LG20染色体的10,999,307bp，其抗病基因型为AA；

所述Carp1175625的物理位置位于LG31染色体的8,238,176bp，其抗病基因型为TT；

所述Carp0745237的物理位置位于LG18染色体的27,587,525bp，其易感基因型为CC；

所述Carp0943001的物理位置位于LG24染色体的21,135,602bp，其易感基因型为TT；

所述Carp1277494的物理位置位于LG34染色体的707,283bp，其易感基因型为TT；

所述Carp1848978的物理位置位于LG50染色体的13,748,395bp，其易感基因型为AA。