[发明专利]一种鉴定美丽硬仆骨舌鱼亲子关系的微卫星标记方法在审
申请号: | 202110328754.X | 申请日: | 2021-03-27 |
公开(公告)号: | CN113005203A | 公开(公告)日: | 2021-06-22 |
发明(设计)人: | 刘奕;牟希东;杨叶欣;刘超;宋红梅;汪学杰;徐猛;房苗;顾党恩 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 广州弘邦专利商标事务所有限公司 44236 | 代理人: | 程长文 |
地址: | 510380 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 美丽 硬仆骨舌鱼 亲子关系 卫星 标记 方法 | ||
1.一种鉴定美丽硬仆骨舌鱼亲子关系的微卫星标记方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)采集美丽硬仆骨舌鱼子代及候选亲本的DNA;
(2)以步骤(1)所取DNA为模板,采用如下SF-1~10共10对微卫星标记引物分别进行PCR扩增,对PCR扩增产物进行检测分析,计算10对微卫星标记的累计排除率,完成亲本与子代的亲子关系鉴定;
所述10对微卫星标记引物序列分别如下:
SF-1:
F:TCTCTGAGCTGAAACGACCG(SEQ ID NO:1);
R:TAAATATGTGTGTGCGCGCG(SEQ ID NO:2);
SF-2:
F:GCAGAGAGCCAGGAAGTGAG(SEQ ID NO:3);
R:GTTGCACCATGGTCTCCAGA(SEQ ID NO:4);
SF-3:
F:TGCAAAGAAGGAGGTGGGAC(SEQ ID NO:5);
R:GCAACAACCATGGGCTTTCC(SEQ ID NO:6);
SF-4:
F:GGAGCCATCACCTTTGTGGA(SEQ ID NO:7);
R:AGGTCCATCCCCTATTGCCT(SEQ ID NO:8);
SF-5:
F:ACCTCCTCCATTAGTGGCCT(SEQ ID NO:9);
R:AGGTTGTACAAGGTGGAGCG(SEQ ID NO:10);
SF-6:
F:TGTGCTGGGAGGCATGAATT(SEQ ID NO:11);
R:TGGTTGTTGTCCTGTGGCTT(SEQ ID NO:12);
SF-7:
F:GAGTAGGGTTGCGCTGAACT(SEQ ID NO:13);
R:CCCTGTGTCTGTGTGGGTTT(SEQ ID NO:14);
SF-8:
F:CGCCATTTAACCAGCATGCA(SEQ ID NO:15);
R:TCAACTGGTGTTCCACAGGG(SEQ ID NO:16);
SF-9:
F:ATGTGCGCTTTCAGGGATCA(SEQ ID NO:17);
R:TGCAGCCGTTTCAGATACCA(SEQ ID NO:18);
SF-10:
F:CCGTTGGAGGGAAGTGTCAT(SEQ ID NO:19);
R:TGTTCATTGACTGCGGGAGG(SEQ ID NO:20)。
2.根据权利要求1所述的一种鉴定美丽硬仆骨舌鱼亲子关系的微卫星标记方法,其特征在于步骤(1)中采集DNA的步骤为:取美丽硬仆骨舌鱼子代及候选亲本的臀鳍组织,用DNA提取试剂盒提取基因组DNA。
3.根据权利要求1或2所述的一种鉴定美丽硬仆骨舌鱼亲子关系的微卫星标记方法,其特征在于步骤(2)中所述PCR扩增的反应体系包括:
10×Buffer 2.5μL;
Mg2+,25mmol/L,1μL;
dNTPs,各2mmol/L,1μL;
上下游引物,10μmol/L,各1μL;
模版DNA,50ng/μL,1μL;
Taq DNA聚合酶,1U;
ddH2O,适量。
4.根据权利要求3所述的一种鉴定美丽硬仆骨舌鱼亲子关系的微卫星标记方法,其特征在于步骤(2)中所述PCR扩增的反应程序如下:
首先94℃预变性3min;然后94℃变性30s,56~60℃退火30s,72℃延伸30s,共30个循环;最后72℃延伸10min。
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