[发明专利]一种快速检测贝莱斯芽胞杆菌的方法及其应用在审
申请号: | 202110339235.3 | 申请日: | 2021-03-30 |
公开(公告)号: | CN113106162A | 公开(公告)日: | 2021-07-13 |
发明(设计)人: | 李宝聚;李磊;许帅;石延霞;谢学文;柴阿丽 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/07 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 闫书宁 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 贝莱斯芽胞 杆菌 方法 及其 应用 | ||
1.特异引物对,包括引物F和引物R;
所述引物F为如下a1)或a2):
a1)SEQ ID NO:2所示的单链DNA分子;
a2)将SEQ ID NO:2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与SEQ IDNO:2具有相同功能的DNA分子;
所述引物R为如下a3)或a4):
a3)SEQ ID NO:3所示的单链DNA分子;
a4)将SEQ ID NO:3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与SEQ IDNO:3具有相同功能的DNA分子。
2.权利要求1所述特异引物对的应用,为b1)或b2)或b3)或b4)或b5)或b6):
b1)检测贝莱斯芽胞杆菌;
b2)鉴定待测菌是否为贝莱斯芽胞杆菌;
b3)评价待测土壤中贝莱斯芽胞杆菌的定殖能力;
b4)制备用于检测贝莱斯芽胞杆菌的试剂盒;
b5)制备用于鉴定待测菌是否为贝莱斯芽胞杆菌的试剂盒;
b6)制备用于评价待测土壤中贝莱斯芽胞杆菌的定殖能力的试剂盒。
3.一种试剂盒,包括权利要求1所述特异引物对。
4.权利要求3所述试剂盒的应用,为b1)或b2)或b3):
b1)检测贝莱斯芽胞杆菌;
b2)鉴定待测菌是否为贝莱斯芽胞杆菌;
b3)评价待测土壤中贝莱斯芽胞杆菌的定殖能力。
5.权利要求3所述试剂盒的制备方法,包括将权利要求1所述特异引物对中的各引物分别单独包装的步骤。
6.鉴定待测菌是否为贝莱斯芽胞杆菌的方法,为Q1)或Q2):
Q1)以待测菌的基因组DNA为模板,采用权利要求1所述特异引物对进行PCR扩增,然后进行如下判断:如果PCR扩增产物中含有大小为193bp的DNA片段,则待测菌为或疑似为贝莱斯芽胞杆菌;如果PCR扩增产物中不含有大小为193bp的DNA片段,则待测菌不为或疑似不为贝莱斯芽胞杆菌;
Q2)以待测菌的基因组DNA为模板,采用权利要求1所述特异引物对进行PCR扩增,然后进行如下判断:如果PCR扩增产物中含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的DNA片段,则待测菌为或疑似为贝莱斯芽胞杆菌;如果PCR扩增产物中不含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的DNA片段,则待测菌不为或疑似不为贝莱斯芽胞杆菌。
7.检测待测物质是否含有贝莱斯芽胞杆菌的方法,为R1)或R2):
R1)以待测物质的基因组DNA为模板,采用权利要求1所述特异引物对进行PCR扩增,然后进行如下判断:如果PCR扩增产物中含有大小为193bp的DNA片段,则待测物质含有或疑似含有贝莱斯芽胞杆菌;如果PCR扩增产物中不含有大小为193bp的DNA片段,则待测物质不含有或疑似不含有贝莱斯芽胞杆菌;
R2)以待测物质的基因组DNA为模板,采用权利要求1所述特异引物对进行PCR扩增,然后进行如下判断:如果PCR扩增产物中含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的DNA片段,则待测物质为含有或疑似含有贝莱斯芽胞杆菌;如果PCR扩增产物中不含有核苷酸序列如SEQID NO:1所示的DNA片段,则待测物质不含有或疑似不含有贝莱斯芽胞杆菌。
8.评价待测土壤中贝莱斯芽胞杆菌的定殖能力的方法,为S1)或S2):
S1)向待测土壤中接种贝莱斯芽胞杆菌,静置培养;之后提取培养后的待测土壤的基因组DNA并以其作为模板,采用权利要求1所述特异引物对进行PCR扩增;PCR扩增产物中大小为193bp的DNA片段的含量越多,则待测土壤中贝莱斯芽胞杆菌的定殖能力越强;
S2)向待测土壤中接种贝莱斯芽胞杆菌,静置培养;之后提取培养后的待测土壤的基因组DNA并以其作为模板,采用权利要求1所述特异引物对进行PCR扩增;PCR扩增产物中含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的DNA片段的含量越多,则待测土壤中贝莱斯芽胞杆菌的定殖能力越强。
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