[发明专利]检测多子小瓜虫的Taqman探针qPCR检测引物组和应用在审
申请号: | 202110373822.4 | 申请日: | 2021-04-07 |
公开(公告)号: | CN115181803A | 公开(公告)日: | 2022-10-14 |
发明(设计)人: | 张其中;郭书权;付耀武 | 申请(专利权)人: | 暨南大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 崔红丽 |
地址: | 510632 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 多子小瓜虫 taqman 探针 qpcr 引物 应用 | ||
1.组织蛋白酶L基因作为分子靶点在制备检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂中的应用,其特征在于:
所述的组织蛋白酶L基因的GenBank:XM_004039979.1。
2.一种用于检测多子小瓜虫的试剂,其特征在于:包含能够检测多子小瓜虫的权利要求1中所述的组织蛋白酶L基因的引物。
3.根据权利要求2所述的用于检测多子小瓜虫的试剂,其特征在于:
能够检测多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因的引物,序列如下:
Cathepsin F:5’-CAGGAGTTGCTTTCTTTG-3’;
Cathepsin R:5’-CTCCTTTAATTCTTTATAAGTTTTC-3’;
Cathepsin-Probe:5’-FAM-TTTCTCACCATAAAGCTCCTACACATG-BHQ3’。
4.权利要求2或3所述的用于检测多子小瓜虫的试剂在检测、鉴别或诊断多子小瓜虫的试剂盒中的应用。
5.一种用于检测多子小瓜虫的试剂盒,其特征在于:含有权利要求2或3所述的用于检测多子小瓜虫的试剂。
6.一种定量检测多子小瓜虫的方法,其特征在于:包括如下步骤:所述方法为非疾病诊断方法;
(1)提取待测样品DNA;
(2)PCR扩增组织蛋白酶L基因,构建重组质粒,以其为模板建立qPCR反应体系以及用不同拷贝数(Sq)的重组质粒的对数值及其Ct值的关系绘制标准曲线;其中,拷贝数Sq与Ct值的关系为Ct=-3.164×lg(Sq)+36.848,相关系数R2=0.993;
(3)利用建立好的检测方法,加入权利要求2或3所述的用于检测多子小瓜虫的试剂和待测样品DNA,配成qPCR反应体系,进行qPCR反应,得到待测样品的Ct值;
(4)多子小瓜虫定量检测
qPCR完成后,根据Ct值判断:若无扩增,则判断该样品中无多子小瓜虫;若有扩增,则根据建立好的标准曲线计算相应的组织蛋白酶L基因拷贝数,阴性对照的Ct值应无扩增。
7.权利要求6所述的方法,其特征在于:
每只多子小瓜虫的组织蛋白酶L基因拷贝数为7个拷贝数;
步骤(1)中,待测样品为水体、底泥或鱼体组织。
8.权利要求6所述的方法,其特征在于:
步骤(2)、(3)中,qPCR反应体系,为:10×PCR缓冲液2.5μL,25mmol·mL-1的氯化镁3.2μL,2.5mM四种脱氧核苷酸的混合物2μL,10μM的Cathepsin F/R各1μL,10μM的Cathepsin-Probe 0.5μL,5U/μL的Taq酶0.25μL;模板DNA 1μL,灭菌双蒸水12.55μL;反应体系总体积为24μL。
9.权利要求6所述的方法,其特征在于:
qPCR反应条件为:95℃预变性2min,然后95℃变性15s,58℃退火30s;72℃延伸20s,如此40个循环;每次都在58℃退火结束时收集荧光信号;阴性对照的Ct值应不显示。
10.权利要求6所述的方法,其特征在于:
步骤(3)中,以不同拷贝数(Sq)的重组质粒是拷贝数为5.4×100~5.4×109拷贝/μL的重组质粒;具体为5.4×100、5.4×101、5.4×102、5.4×103、5.4×104、5.4×105、5.4×106、5.4×107、5.4×108、5.4×109拷贝/μL的重组质粒。
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