[发明专利]与花生出仁率主效QTL位点qSPA07.1和qSPA08.2连锁的分子标记及应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与花生出仁率主效QTL位点qSPA07.1和qSPA08.2连锁的分子标记及应用。本发明的与花生出仁率主效QTL位点连锁的分子标记为A07.Indel或A08.Indel；分子标记A07.Indel与QTL位点qSPA07.1连锁，所述分子标记A07.Indel能够通过如SEQ ID NO.1‑2所示的引物对扩增得到；分子标记A08.Indel与QTL位点qSPA08.2连锁，所述分子标记A08.Indel能够通过如SEQ ID NO.3‑4所示的引物对扩增得到。采用本发明的分子标记能够在花生育种中辅助选择高出仁率的材料，有利于提高高出仁率品种的选育效率。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与花生出仁率主效QTL位点连锁的分子标记及其应用。

背景技术

花生(Arachis hypogea L.)是世界范围内重要的油料作物和经济作物，是重要的食用植物油脂和蛋白质来源。花生种子富含油脂、蛋白质、维生素和其他优异的矿质元素，除了鲜食外还可以加工为食用油、花生酱、坚果、点心等。出仁率是花生籽仁重量占荚果重量的百分比，是影响花生产量的重要因素。因此提高出仁率是花生生产上重要的育种目标之一。如何快速、准确选育高出仁率的花生品种是花生遗传改良研究的重要方向。

常见花生核心种质中出仁率表型变异在59.9％-81％之间，具有较大的遗传改良潜力。出仁率与大多数重要的产量性状一样是数量性状，容易受到环境的影响。因此常规育种直接对材料出仁率表型的选择往往效率不高，周期长。

QTL分析是通过对样本的表型结果和分子标记基因型进行连锁分析，在高密度遗传连锁图谱上定位控制某一性状的多个位点，从而将复杂的数量性状进行分解为控制数量性状的多个基因。随着测序成本的降低，可以通过重测序、简化基因组测序等开发全基因组高密度的分子标记，以此构建高密度的遗传连锁图谱，结合表型数据，利用连锁分析方法可以在基因组上精细定位到多个控制目标农艺性状的QTL位点。通过与QTL紧密连锁的分子标记对目标表型性状进行选择，可以提高目标性状的育种效率。

目前检测到的花生出仁率的QTL数目相对较少，效应值偏低，在不同环境表达的稳定性未知，在花生育种中应用有限。

发明内容

本发明针对现有技术的不足，目的在于提供两个稳定的花生出仁率主效 QTL位点及其连锁的标记，用于高出仁率的花生材料的分子标记辅助选择。

具体地，本发明提供如下技术方案：

第一方面，本发明提供与花生出仁率主效QTL位点连锁的分子标记，所述分子标记为A07.Indel或A08.Indel；

分子标记A07.Indel与QTL位点qSPA07.1连锁，所述分子标记A07.Indel能够通过如SEQ ID NO.1-2所示的引物对扩增得到；

分子标记A08.Indel与QTL位点qSPA08.2连锁，所述分子标记A08.Indel能够通过如SEQ ID NO.3-4所示的引物对扩增得到。

第二方面，本发明提供与花生出仁率主效QTL位点连锁的分子标记组合，所述分子标记组合包括A07.Indel和A08.Indel，分子标记A07.Indel和分子标记 A08.Indel如上所述。

第三方面，本发明提供用于扩增上述分子标记或分子标记组合的引物。

所述引物包括如SEQ ID NO.1-2和/或SEQ ID NO.3-4所示的序列。

第四方面，本发明提供含有上述引物的试剂或试剂盒。

第五方面，本发明提供上述分子标记或分子标记组合或引物或试剂或试剂盒的以下任一应用：

(1)在鉴定花生出仁率性状表型中的应用；