[发明专利]侵袭性曲霉病病原菌的引物和探针及其实现方法、检测系统有效
申请号: | 202110452771.4 | 申请日: | 2021-04-26 |
公开(公告)号: | CN113106167B | 公开(公告)日: | 2022-09-20 |
发明(设计)人: | 宋营改;刘晓;李若瑜 | 申请(专利权)人: | 北京大学第一医院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/66;C12R1/68;C12R1/67;C12R1/685 |
代理公司: | 北京元本知识产权代理事务所(普通合伙) 11308 | 代理人: | 金海荣 |
地址: | 100034 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 侵袭 曲霉 病原菌 引物 探针 及其 实现 方法 检测 系统 | ||
1.一种侵袭性曲霉病病原菌的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针包括用于检测侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针,其核苷酸序列如下:
正向引物:5’-GCCTGTCCGAGCGTCATT-3’;
反向引物:5’-GCCCCATACGCTCGAGG-3’;
探针:FAM-CGGCTTGTGTGTTGGG-MGB;
所述引物和探针还包括用于检测侵袭性曲霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针,所述种特异性引物和探针包括以下至少一组:
烟曲霉的种特异性引物和探针,其核苷酸序列如下:
正向引物:5’-AGTGGGACCGCAAGTGACAT-3’;
反向引物:5’-CCCACGATCCATCTTCGATT-3’;
探针:FAM-CATGTGTTTGGCCTGC-MGB;
黄曲霉的种特异性引物和探针,其核苷酸序列如下:
正向引物:5’-TTTTTGCCAGCCGACATCTC-3’;
反向引物:5’-AATCTTCGTGCAGGGTGTCAA-3’;
探针:VIC-TCGAAGTAGATGGGATCAT-MGB;
土曲霉的种特异性引物和探针,其核苷酸序列如下:
正向引物:5’-CAACCTCGGTGCCGACAT -3’;
反向引物:5’-CGTCGCCAAAATCCTTGAAA-3’;
探针:TAMRA-CTCGTAGGTGCGGATC-MGB;
黑曲霉的种特异性引物和探针,其核苷酸序列如下:
正向引物:5’-CAATCAGTTCGCAACTCTCACAA-3’;
反向引物:5’-CTGGCGCAGATTTCTTGGAT-3’;
探针:FAM-CCCCACCCGAACAC-MGB;
构巢曲霉的种特异性引物和探针,其核苷酸序列如下:
正向引物:5’-ATAACGGCCTCGCAATTGC-3’;
反向引物:5’-TCAATCGCCCTGTCAAGACA-3’;
探针:FAM-CGTTCATGAGAACCGCATCCGACA-BHQ1。
2.一种侵袭性曲霉病病原菌的引物和探针的实现方法,其特征在于,所述方法包括:
对已获取的侵袭性曲霉病病原菌各菌种的全基因组数据进行比对,得到侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因;
利用通过全基因组比对得到的侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的如上述权利要求1中所述的侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针以及如上述权利要求1中所述的侵袭性曲霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述利用通过全基因组比对得到的侵袭性曲霉病病原菌的多个保守基因,设计特异性满足要求的如上述权利要求1中所述的侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针以及如上述权利要求1中所述的侵袭性曲霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针包括:
对于每个保守基因,通过在侵袭性曲霉病病原菌的种间及种内进行碱基比对,从所述保守基因中确定侵袭性曲霉病病原菌的保守片段以及每种侵袭性曲霉病病原菌的种特异性片段;
利用从所述保守基因中得到的侵袭性曲霉病病原菌的保守片段,设计用于检测侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针,并利用从所述保守基因中得到的每种侵袭性曲霉病病原菌的种特异性片段,设计用于检测每种侵袭性曲霉病病原菌的种特异性引物和探针;
对已设计的用于检测侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针和用于检测每种侵袭性曲霉病病原菌的种特异性引物和探针分别进行特异性检测,得到特异性满足要求的侵袭性曲霉病病原菌的通用引物和探针以及侵袭性曲霉病病原菌各菌种的种特异性引物和探针。
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