[发明专利]一种与肉牛肉质性状相关联的BBS2分子标记及其检测试剂盒

权利要求书

1.一种与肉牛肉质性状相关联的BBS2分子标记，其特征在于，根据NCBI数据库中牛BBS2基因序列GenBank号：AC_000175.1，该分子标记位于BBS2基因编码区的g.24223562G/A位点、g.24226239C/T位点和g.24227851G/A位点；其中，g.24223562G/A位点与眼肌面积、肌间脂肪含量性状显著相关，g.24226239C/T位点与眼肌深度性状显著相关，g.24227851G/A位点与肌间脂肪含量性状显著相关。

2.检测权利要求1所述的与肉牛肉质性状相关联的分子标记的引物对用于制备检测BBS2基因型试剂盒的应用，所述引物对分别为：

第一引物对：用于检测g.24223562G/A位点基因型

5’-GGTGTTACTGACACACGGCT-3’；

5’-ACTGTCCTCTCAGTGTTGCC-3’；

第二引物对：用于检测g.24226239C/T位点基因型

5’-AGTAGTGTTTTCTTGGTGGGGA-3’；

5’-TGAGATTGGTGTCACTCGCC-3’；

第三引物对：用于检测g.24227851G/A位点基因型

5’-AAACAGGGCCTCGGTACAAA-3’；

5’-TCAAATGCCTAAGGCCAGCA-3’。

3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，试剂盒用于预测肉牛肉质性状的方法是：检测BBS2基因SNPs位点g.24223562G/A、g.24226239C/T和g.24227851G/A；其中，g.24223562G/A位点GG、GA基因型个体眼肌面积显著高于AA基因型个体，GG、GA基因型个体肌间脂肪含量极显著高于AA基因型个体；g.24226239C/T位点CC基因型个体眼肌深度显著高于TT基因型个体；g.24227851G/A位点GG、GA基因型个体肌间脂肪含量显著高于AA基因型个体；

具体步骤如下：

第一步：采集肉牛的血液或组织样进行全基因组DNA的提取，利用琼脂糖凝胶电泳检查DNA的质量；

第二步：以全基因组DNA为模板，用试剂盒扩增并检测BBS2基因多态性位点，PCR的反应程序为95℃预变性3min；98℃变性10s，60℃退火10s，72℃延伸10s，32个循环；延伸72℃5min，最后4℃保存；

第三步：对PCR样品进行测序，根据测序结果判定g.24223562G/A、g.24226239C/T、g.24227851G/A位点基因型；

第四步：选留g.24223562G/A位点GG，GA基因型个体，g.24226239C/T位点CC基因型个体，g.24227851G/A位点GG，GA基因型个体，该肉牛个体在眼肌面积、眼肌深度、肌间脂肪含量方面具有优势。

4.如权利要求2所述的应用，其特征在于，试剂盒用于肉牛肉质性状早期选择的方法包括如下步骤：

1)检测BBS2基因SNPs位点g.24223562G/A、g.24226239C/T和g.24227851G/A的基因型；

2)对检测的基因型进行牛早期选种，其中g.24223562G/A位点GG、GA基因型眼肌面积、肌间脂肪含量优于AA基因型个体；g.24226239C/T位点CC基因型眼肌深度优于TT基因型个体；g.24227851G/A位点GG、GA基因型肌间脂肪含量优于AA基因型个体；选留g.24223562G/A位点GG、GA基因型个体，g.24226239C/T位点CC基因型个体，g.24227851G/A位点GG、GA基因型个体留种。