[发明专利]一种与肉牛肉质性状相关联的BBS2分子标记及其检测试剂盒

说明书

本发明公开了一种与肉牛肉质性状相关的BBS2分子标记、检测试剂盒及其应用，该分子标记位于BBS2基因编码区的g.24223562G/A位点、g.24226239C/T位点和g.24227851G/A位点，与肉牛眼肌面积、眼肌深度、肌间脂肪含量肉质性状显著相关。是一个潜在的秦川牛为代表的地方黄牛肉用选育遗传标记。基于这一发现，研制了快速检测BBS2基因型预测肉牛肉质性状的试剂盒，可用于秦川牛为代表的地方黄牛早期选种，加快肉牛遗传进展，节约生产成本。实现肉牛早期选种留种，加快肉牛肉用选育进程。

技术领域

本发明属于动物分子标记技术领域，具体地说，涉及一种与肉牛肉质性状相关的BBS2分子标记、检测试剂盒及其应用。

背景技术

畜禽良种是畜牧业的“芯片”，对畜牧业发展的贡献率超过40％。我国有55个地方黄牛品种，是世界上牛品种资源最为丰富的国家之一。然而，由于受长期以役用为主，肉用选育起步较晚等影响，目前支撑我国肉牛产业发展的地方黄牛与国外专门化肉牛品种相比，普遍存在着生长速度慢、胴体产肉少、牛肉品质低等诸多不足。通过引进国外优良肉牛品种改良地方黄牛品种尽管取得了一定的成效，但也存在着引种——退化——再引种的不良局面，导致我国肉牛良种长期以来依赖于进口，不利于我国肉牛产业健康可持续发展。因此，如何提高我国地方黄牛本品种选育力度，加快地方黄牛品种肉用选育进程，是肉牛产业发展中急需解决的问题。

肉牛生长、肉质等经济性状均为数量性状，常规育种通过基于外貌评定、性能测定和谱系记录等表型和估计育种值的方法进行选择，在肉牛育种中获得了一定的进展。然而，由于肉牛世代间隔长，繁殖率低等问题的存在，导致肉牛常规育种方法选育进展相对缓慢。近年来，随着分子遗传学的发展，在定位肉牛数量性状相关基因座(quantitative traitlocus，QTL)和挖掘性状相关主效基因基础上，基于单核苷酸多态性(SNP)进行肉牛分子标记辅助育种(marker-assisted selection，MAS)，实现了肉牛早期选种，提高了肉牛目标性状的选育速度和准确度。常规选育和分子标记辅助选择育种的联合，对于加快我国畜禽种业发展，培育具有自主知识产权的地方畜禽新品种，摆脱对国外优良畜禽品种的依赖具有重要意义。

BBS2基因属Bardet-Biedl综合征(BBS)基因家族的成员。Bardet-Biedl综合征是一种常染色体隐性遗传病，以严重的肥胖、视网膜病变等为主要特征。有研究表明，BBS2基因敲除导致了小鼠的肥胖。进一步研究发现，BBS2的突变导致了瘦素蛋白(Leptin)受体的膜定位异常，阻断了瘦素信号通路，进而导致肥胖。BBS1、BBS2、BBS4、BBS5、BBS7、BBS8、BBS9、BBS18等家族蛋白通过组装形成BBS复合体(BBSome)发挥作用。BBS2基因突变与人类肥胖性状显著相关，BBS2单核苷酸多态性与成人肥胖相关(P＝0.0005)，BBS4和BBS6单核苷酸多态性与早发性儿童肥胖(P＝0.0003)。进一步研究发现，BBS2R632P突变可能通过影响BBS2与BBS9蛋白互作面结合，影响了BBSome复合体结构与功能，导致了人类肥胖。

对我国秦川牛为代表的地方黄牛及国外专门化肉牛品种和牛、安格斯牛等基因组重测序分析发现，BBS2基因在和牛群体中受到了强烈的选择，这可能是导致和牛肌内脂肪沉积丰富的一个重要原因。上述研究表明，BBS2可能是肉牛肉质性状相关的重要候选功能基因。然而，目前关于该基因SNPs研究及其与肉牛生长、肉质性状相关性分析未见报道。

发明内容

为了解决肉牛产业及选育技术中存在的肉牛选育周期长、育种进展缓慢的技术问题，本发明的目的在于，提供一种与肉牛肉质性状相关的BBS2分子标记及其快速检测试剂盒，可用于肉牛肉用早期选种。

为了实现上述任务，本发明采取以下的技术解决方案：

一种与肉牛肉质性状相关联的BBS2分子标记，其特征在于，该分子标记位于BBS2基因编码区的g.24223562G/A位点、g.24226239C/T位点和g.24227851G/A位点，与肉牛眼肌面积、眼肌深度、肌间脂肪含量肉质性状显著相关。