[发明专利]一种SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药的引物探针组合、试剂盒及基因检测方法在审
申请号: | 202110523932.4 | 申请日: | 2021-05-13 |
公开(公告)号: | CN113337593A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 付洁;李华柏;冀元凯;宋海峰 | 申请(专利权)人: | 广西金则医学科技发展有限公司;北京金则医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 贵州派腾知识产权代理有限公司 52114 | 代理人: | 朱雪琼 |
地址: | 538021 广西壮族自治区防城港市防城*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 ssris 三环类抗 抑郁 精准 用药 引物 探针 组合 试剂盒 基因 检测 方法 | ||
1.一种SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药的引物探针组合,其特征在于:所述引物探针组合依据所选抗抑郁症药物相关基因及基因位点进行设计,含有特异性引物和探针,该引物探针组合如SEQ ID NO.1~28所示序列。
2.根据权利要求1所述的一种SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药的引物探针组合,其特征在于:所述抗抑郁症药物相关基因为CYP2C19、CYP2D6;所述基因位点为CYP2C19基因有3个位点,分别为rs4244285、rs4986893和rs12248560;CYP2D6基因有3个位点,分别为rs3892097、rs1065852和*5插入缺失分型。
3.根据权利要求1所述的一种SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药的引物探针组合,其特征在于:所述抗抑郁药物为SSRIs类抗抑郁药或三环类抗抑郁药;所述SSRIs类抗抑郁药属于选择性5-羟色胺再摄取抑制剂,该SSRIs类抗抑郁药为帕罗西汀、舍曲林、氟伏沙明、西酞普兰、艾斯西酞普兰中的一种或一种以上;所述三环类抗抑郁药为阿米替林、多塞平、丙米嗪、氯丙咪嗪、氯米帕中的一种或一种以上。
4.一种用于SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药基因检测的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括SNP分型所用的KASP反应液和CYP2D6*5基因拷贝数分析所用的taqman探针法QPCR反应液;所述KASP反应液成分包括反应缓冲液、分型引物、通用探针、dNTP、ROX、PCR酶,且各条分型引物的浓度均为0.2μM,各条通用探针的浓度均为0.4~0.6μM,dNTP的浓度为0.4mM,PCR酶为1U;所述QPCR反应液成分包括内参及检测基因上游引物、下游引物、taqman探针、SuperReal反应液、ROX,且各条引物的浓度均为0.3μM,各条taqman探针的浓度均为0.2μM,SuperReal反应液为2×。
5.根据权利要求4所述的一种用于SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药基因检测的试剂盒,其特征在于:所述KASP反应液制备时反应的程序为:(I)94℃,10min;(II)94℃,20s;61℃~55℃(每循环降低0.6℃),45s;10个循环;(Ⅲ)94℃,20s;55℃,45s;37~40个循环;(Ⅳ)35℃,45s,采集信号;所述QPCR反应液制备时反应的程序为:(I)95℃,15min;(II)95℃,3s;60℃,30s,采集信号;40个循环。
6.根据权利要求4所述的一种用于SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药基因检测的试剂盒,其特征在于:所述反应缓冲液每50μL中含有以下组分:20μL的5×PCRbuffer、0.4mM的dNTP(10μm)、0.12μM的50×ROX、1μL的TaqEnzyme、0.2μM的HEX-突变型探针(10μm)、0.4μM的Q-HEX-突变型淬灭探针(10μm)、0.2μM的FAM-野生型探针(10μm)、0.6μM的Q-FAM-野生型猝灭探针(10μm)、补ddH2O至50μL。
7.根据权利要求4所述的一种用于SSRIs类及三环类抗抑郁精准用药基因检测的试剂盒,其特征在于:所述SuperReal反应液每20μL中含有以下组分:10μL的2×SuperReal反应液、0.3μM的内参上游引物(10μm)、0.3μM的内参下游引物(10μm)、0.2μM的内参taqman探针(10μm)、0.3μM的CYP2D6*5上游引物(10μm)、0.3μM的CYP2D6*5下游引物(10μm)、0.2μM的CYP2D6*5taqman探针(10μm)、0.2μLROX、4.6μLddH2O。
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