[发明专利]一种应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物及其应用在审
申请号: | 202110564426.X | 申请日: | 2021-05-24 |
公开(公告)号: | CN113122615A | 公开(公告)日: | 2021-07-16 |
发明(设计)人: | 朱方何;袁光孝;林东旭;周怡;任胜强;陈杰 | 申请(专利权)人: | 广州赛哲生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 510000 广东省广州市国际生物岛螺旋四路一号研发A区第*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用于 绝对 定量 通量 多重 pcr 扩增 分子 标签 引物 及其 应用 | ||
1.一种应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物,其特征在于,所述单分子标签引物包括:5’端修饰基团、核苷酸片段和3’端修饰基团;
所述5’端修饰基团包括UMI分子标签和通用引物接头,其中,所述UMI分子标签与核苷酸片段的5’端相连,所述通用引物接头与UMI分子标签5’端相连;
所述核苷酸序列与目标序列匹配,用于扩增所述目标序列;
所述3’端修饰基团包括RNA残基、DNA保护碱基和封闭基团,其中,所述RNA残基与核苷酸片段的3’端相连,所述DNA保护碱基与RNA残基相连,所述封闭基团与DNA保护碱基相连。
2.根据权利要求1所述的应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物,其特征在于,所述UMI分子标签包括随机碱基;
优选地,所述随机碱基的数量为2~15个,优选为10个;
优选地,所述通用引物接头包括所述目标序列非同源序列的通用引物,优选为测序平台测序引物的部分或全部序列;
优选地,所述通用引物的长度为10~30bp,优选为15~25bp。
3.根据权利要求1或2所述的应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物,其特征在于,所述RNA残基的数量为1~10个;
优选地,所述RNA残基包括A、U、G或C中的任意一种或至少两种的组合;
优选地,所述DNA保护碱基的数量为不少于1;
优选地,所述DNA保护碱基包括A、T、G或C中的任意一种或至少两种的组合;
优选地,所述封闭基团包括C3间隔、C5间隔、C6间隔、双脱氧胞苷、氨基或碱基倒置中的任意一种或至少两种的组合。
4.一种权利要求1~3任一项所述的应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物的制备方法,其特征在于,所述制备方法包括:
合成核苷酸片段序列,将UMI分子标签和通用引物接头按顺序依次连接到所述核苷酸片段序列的5’端,再将RNA残基、DNA保护碱基和封闭基团按顺序依次连接到所述核苷酸片段序列的3’端,得到所述应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物。
5.一种应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的配套试剂,其特征在于,所述配套试剂包括权利要求1~3任一项所述的应用于绝对定量高通量测序的多重PCR扩增的单分子标签引物;
优选地,所述配套试剂还包括扩增反应体系;
优选地,所述扩增反应体系包括酶和缓冲液。
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