[发明专利]一种DENND1A-SGTA融合基因及其应用和检测试剂盒

说明书

本发明提供一种DENND1A‑SGTA融合基因及其应用和检测试剂盒，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。本发明首先发现、鉴定了急性淋巴细胞白血病中存在新融合基因DENND1A‑SGTA，评估认为DENND1A‑SGTA可以作为急性淋巴细胞白血病的特异性分子标志物，进而开发了一款临床上可用于诊断、检测患者微小残留病(MRD)的试剂盒。试剂盒利用Taqman探针实时荧光PCR对急性淋巴细胞白血病患者体内DENND1A‑SGTA融合基因进行绝对定量，其检测特异性好、灵敏度高、方法简便高效、成本低廉，能够满足临床上的诊疗需求。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种急性淋巴细胞白血病融合基因及其应用和检测试剂盒。

背景技术

急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)是一种血液恶性肿瘤，占所有急性淋巴细胞白血病的80–85％，其特征是B淋巴母细胞在骨髓，外周血和淋巴器官中增殖及广泛浸润。在过去的数十年中，通过骨髓细胞学，免疫分型，分子残留(尤其是BCR-ABL融合基因的发现)等监测方法，B-ALL存活率已显著提高，然而成人和老年患者的5年总生存率(OS)仍然只有30％–40％。随着分子遗传诊断学的迅速发展，目前在B-ALL中已经有BCR-ABL1,E2A-PBX1,ETV6-RUNX1,MLL重排等几十种融合基因被报道，但仍然有很大比例的B-ALL患者缺乏分子标志，从而为临床诊断和治疗预后带来很大困难。因此与B-ALL相关的新融合基因的发现对于病情诊断、治疗方案制定、疗效评价、预后评估及病变复发的监测具有重要的临床意义。

DENND1A基因，又称DENN Domain Containing 1A，该基因的主要功能是可促进GDP转换为GTP，调节网格蛋白介导的突触小泡内吞并介导早期内体的退出。SGTA基因即smallglutamine rich tetratricopeptide repeat co-chaperone alpha，该基因在各种组织中普遍表达，其编码蛋白质可通过与BAG6的相互作用参与折叠错误的蛋白质分解代谢过程的调控。上述两个基因在该B-ALL患者里形成了一种新融合基因DENND1A-SGTA，并且是至今未见文献报道的分子标志物。

发明内容

本发明的第一个目的在于，提供一种急性淋巴细胞白血病融合基因DENND1A-SGTA。

本发明的第二个目的在于，提供融合基因DENND1A-SGTA在制备急性淋巴细胞白血病诊断或监测试剂盒中的应用。

本发明的第三个目的在于，提供一种检测DENND1A-SGTA融合基因的试剂盒。

本发明第四个目的在于，提供一种非疾病诊断目的的检测DENND1A-SGTA融合基因的方法。

为了实现上述第一个目的，本发明提供了一种DENND1A-SGTA融合基因，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。

为了实现上述第二个目的，本发明提供了融合基因DENND1A-SGTA在制备急性淋巴细胞白血病诊断或监测试剂盒中的应用。部分急性淋巴细胞白血病患者携带融合基因DENND1A-SGTA，其可以作为患者特异性的分子标志物，并应用于临床诊断、定期监测患者的微小残留病变。

为了实现上述第三个目的，本发明提供了一种检测融合基因DENND1A-SGTA的试剂盒，所述试剂盒包括上游引物、下游引物、Taqman探针、内参、PCR反应缓冲液、阳性对照和阴性对照；

所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；

所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

所述Taqman探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。