[发明专利]一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV的试剂及方法在审
申请号: | 202110594315.3 | 申请日: | 2021-05-28 |
公开(公告)号: | CN113186355A | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 曹洪志;李成贤;李雪梅 | 申请(专利权)人: | 宜宾职业技术学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 成都行之专利代理事务所(普通合伙) 51220 | 代理人: | 史丽红 |
地址: | 644000 *** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 采用 二联 pcr 检测 ppv jev 试剂 方法 | ||
1.一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV的试剂,其特征在于,包含能扩增PPV的NS1基因和JEV的NS1基因的两对特异性引物,其中P1和P2引物扩增PPV的NS1基因片段,扩增长度为750bp,P3和P4引物扩增JEV的NS1基因片段,扩增长度为475bp;
所述引物序列为如下核苷酸序列:
P1:SEQ ID NO:1;
P2:SEQ ID NO:2;
P3:SEQ ID NO:3;
P4:SEQ ID NO:4。
2.根据权利要求1所述的一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV的试剂,其特征在于,包括10×PCR缓冲液2.5μL,2.5mmol/L dNTP 4μL,25mmol/L Mg2+溶液3.5μL,40μmol/L P1、P2混合物0.7μL,40μmol/L P3、P4混合物0.3μL,JEV cDNA1μL、PPV DNA1μL,Taq DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,ddH2O 11.6μL,其中JEV cDNA是JEV抽提后的RNA经过反转录后得到的cDNA。
3.一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV试剂的制备方法,其特征在于,主要包括以下步骤:
(1)PPV的NS1基因和JEV的NS1基因序列的选择:从GenBank数据库中下载已经发表的PPV-VRI-1株的NS1、JEV-WHe株的NS1基因序列;
(2)根据选择的PPV的NS1基因和JEV的NS1基因的靶序列,用PCR引物设计软件分别进行引物的设计,将设计的引物进行最佳配对筛选试验,得到2最佳引物:P1、P2及P3、P4,用全自动DNA合成仪进行引物的合成,其中P1和P2引物扩增PPV的NS1基因片段,扩增长度为750bp,P3和P4引物扩增JEV的NS1基因片段,扩增长度为475bp;
所述引物序列为如下核苷酸序列:
P1:SEQ ID NO:1;
P2:SEQ ID NO:2;
P3:SEQ ID NO:3;
P4:SEQ ID NO:4。
4.一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV的方法,其特征在于,主要包括以下步骤:
(1)样品的处理;
(2)病料样品RNA/DNA的提取;
(3)二联PCR反应:
采用25μL PCR反应体系;PCR反应体系的组成为:包括10×PCR缓冲液2.5μL,2.5mmol/LdNTP 4μL,25mmol/L Mg2+溶液3.5μL,40μmol/L P1、P2混合物0.7μL,40μmol/L P3、P4混合物0.3μL,JEV cDNA1μL、PPV DNA1μL,Taq DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,去ddH2O 11.6μL;PCR反应条件为:95.5℃,预变性5min;95℃,变性30s;53.3℃,退火30s;72℃,延伸45s,共35个循环,最后72℃延伸5min,其中JEV cDNA是JEV抽提后的RNA经过反转录后得到的cDNA;
(4)结果判定
取二联PCR产物在琼脂糖凝胶上,电泳后在凝胶成像系统中观察拍照,以标准DNAmarker(D,L-2000)作参考;电泳后,若琼脂糖凝胶中同时出现2条核酸带,且片段大小分别为750bp和475bp,说明病料样品中同时含有PRV、JEV病毒;如果仅出现其中一个对应长度的核酸片段,则表明病料样品中只含有其中一种病毒;若不出现任何核酸片段,则表明病料样品中不含有PRV、JEV病毒。
5.根据权利要求4所述的一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV的方法,其特征在于,步骤(4)中,取5μl产物在1.5%的琼脂糖凝胶上电泳30min后在凝胶成像系统中进行观察。
6.根据权利要求4所述的一种采用二联PCR检测猪PPV、JEV的方法,其特征在于,步骤(3)中,JEV的cDNA的合成反应体系:5×PrimeScriptTM缓冲液2μL,PrimeScriptTMRT-EnzymeMix I 0.5μL,40μmol/L Specific down primer 0.25μL,总RNA 2μL,RNase Free ddH2O5.52μL。
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