[发明专利]与胃癌预后相关的标志分子有效
申请号: | 202110594423.0 | 申请日: | 2021-05-28 |
公开(公告)号: | CN113337605B | 公开(公告)日: | 2022-06-07 |
发明(设计)人: | 王艳;余和芬;黄蔚;霍苗苗 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G16H50/30;G16H50/20 |
代理公司: | 北京睿阳联合知识产权代理有限公司 11758 | 代理人: | 景鹏;郭奥博 |
地址: | 100069 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胃癌 预后 相关 标志 分子 | ||
1.胃癌预后效果的评价系统,其特征在于,所述系统包括:
(1)数据输入模块,用于将样品中与胃癌预后相关的标志分子的表达量检测结果输入模型计算模块;所述表达量为标志分子对应的mRNA含量;
所述标志分子包括如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8以及SEQ ID NO:9所示基因序列;
(2)模型计算模块,用于对输入的检测结果进行计算处理,得到被测患者的预后效果数据;
(3)结果输出模块,用于根据胃癌预后效果评价标准对被测患者的预后效果数据进行评价,输出评价结果;
所述模型计算模块采用的模型具体为:
Risk Score = EXP ZFP64 * (-0.044) + EXP TOMM34 * (-0.041) + EXP DNMT3B *(0.131) + EXP CSTF1 * (-0.273) + EXP TM9SF4 * (0.264) + EXP TTI1 * (0.136) +EXP ACTR5 * (-0.255) + EXP STK35 * (-0.006) + EXP SS18L1 * (-0.047);
其中,ZFP64代表样品中如SEQ ID NO:1所示基因序列的表达量,TOMM34代表样品中如SEQ ID NO:2所示基因序列的表达量,DNMT3B代表样品中如SEQ ID NO:3所示基因序列的表达量,CSTF1代表样品中如SEQ ID NO:4所示基因序列的表达量,TM9SF4代表样品中如SEQID NO:5所示基因序列的表达量,TTI1代表样品中如SEQ ID NO:6所示基因序列的表达量,ACTR5代表样品中如SEQ ID NO:7所示基因序列的表达量,STK35代表样品中如SEQ ID NO:8所示基因序列的表达量,SS18L1代表样品中如SEQ ID NO:9所示基因序列的表达量;所述表达量为基因序列对应的mRNA含量;
所述结果输出模块中,以最优cutoff值-0.331为截断值,将样本分为高、低风险组,据此对被测患者的预后效果数据进行评价;如果患者的Risk Score值高于该截断值,则为高风险;如果患者的Risk Score值低于该截断值,则为低风险。
2.权利要求1所述评价系统在胃癌患者预后评价中的应用。
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