[发明专利]检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒

说明书

本发明涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒，所述试剂盒含有检测以下基因表达量的检测试剂：RP11‑539L10.2、AKR1C2、RP11‑572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5‑827L5.2、CTD‑2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11‑545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1‑388B5.2、RP11‑267L5.1、TRAV11、RP11‑699A7.1、AL132671.1。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变，经TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库，实验以及多组学数据库验证，发现该预测方法具有准确性高，特异性好的优点，有很好的应用前景。

技术领域

本发明涉及分子诊断技术领域，尤其是涉及检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的试剂盒。

背景技术

肺癌作为最常见的恶性肿瘤，其死亡率在世界范围内高居所有肿瘤榜首。肺腺癌是肺癌中最常见的亚型，占据肺癌病例的40％以上。针对肺腺癌的各种靶向药物的出现明显提高了肺腺癌患者的预后，使肺腺癌的治疗已经进入分子时代。如何能够准确评估肺腺癌的分子特征，对于患者的精准治疗和减轻社会负担意义重大。

抗氧化应激通路对于肺癌的发生发展有着巨大的作用，尽管在正常生理条件下，该通路能够抵御外界环境的氧化应激(ROS)及其对人体的伤害，但是在肺腺癌中该通路的过度激活，对于促进肿瘤进展、耐药和肿瘤异质性形成有着重要意义。在肺腺癌中，KEAP1、NFE2L2和CUL3基因具有较高的突变率且与抗氧化应激通路高度相关。上述基因的突变可使肿瘤细胞中的氧化应激状态得到过度激活，该通路下游基因的高表达引起肿瘤代谢重编程和内部免疫微环境的改变，进而促进肿瘤进展、耐药和肿瘤异质性形成，导致显著更差的预后生存。目前针对重要突变基因如EGFR的靶向药物治疗在肺腺癌的应用已经得到了广泛的认可和获益。针对 KEAP1、NFE2L2和CUL3相关的抗氧化应激通路的靶向药物也已经在开展临床试验中，预示着未来积极的前景。

然而目前肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的检测并非临床常规项目，单独检测价格昂贵。

发明内容

针对目前肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的检测普及性较差以及成本较高的现状，本发明提供一种检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的组合物以及试剂盒，同时还提供检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因突变的组合物以及试剂盒的应用。

本发明的目的可以通过以下技术方案来实现：

第一方面，本发明提供一组基因组合物的应用，所述基因组合物在制备评估肺腺癌是否存在抗氧化应激通路相关基因KEAP1、NFE2L2、CUL3突变的试剂盒上的应用，所述基因组合物由RP11-539L10.2、AKR1C2、RP11-572H4.1、TRIM16L、 RARA、SESN2、RP5-827L5.2、CTD-2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、 RP11-545H22.1、KRT8P30、TALDO1、TRAPPC13P1、GS1-388B5.2、RP11-267L5.1、 TRAV11、RP11-699A7.1、AL132671.1组成。

第二方面，本发明提供检测肺腺癌抗氧化应激通路相关基因KEAP1、NFE2L2、 CUL3突变的组合物，所述组合物由检测以下基因表达量的检测试剂组成： RP11-539L10.2、AKR1C2、RP11-572H4.1、TRIM16L、RARA、SESN2、RP5-827L5.2、 CTD-2139B15.5、Metazoa_SRP、snoU13、RP11-545H22.1、KRT8P30、TALDO1、 TRAPPC13P1、GS1-388B5.2、RP11-267L5.1、TRAV11、RP11-699A7.1、AL132671.1。