[发明专利]一种检测杧果细菌性角斑病菌的引物组及方法和应用

说明书

本发明公开了一种检测杧果细菌性角斑病菌的引物组及方法和应用，包括引物对XcmU1‑FR、XcmU2‑FR和XcmU3‑FR，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1～2、SEQ ID NO.3～4和SEQ ID NO.5～6所示。利用上述特异性引物进行扩增，得到扩增产物，扩增产物进行凝胶电泳，依据凝胶电泳结果进行判断：若能扩增出大小分别为297bp、237bp和357bp的产物中的任意一条或多条产物，则认为该样品中存在杧果细菌性角斑病菌。本发明引物用于检测杧果细菌性角斑病菌具有操作简单、结果快捷准确的特点。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及一种检测杧果细菌性角斑病菌的引物组及方法和应用。

背景技术

杧果，也叫芒果，是一种十分重要的热带经济水果，主要栽培于热带和亚热带地区，在世界范围内被广泛种植。杧果细菌性角斑病是由杧果细菌性角斑病菌(Xanthomonascitri pv.mangiferaeindicae,Xcm)引起，是一种严重威胁杧果安全生产的细菌性病害，在全世界杧果种植区内均有发生，发病时会造成杧果产量严重下降、品质严重降低。杧果细菌性角斑病的防治目前主要是以早期的预防为主，但由于发病早期，其病斑特征不明显，容易错过最佳的防控时机，导致发病后难以控制，造成严重的经济损失。因而，开发一种方便、快捷、灵敏、准确的鉴定杧果细菌性角斑病菌的方法对有效防治杧果细菌性角斑病具有重要的作用。

聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术，它可看作是生物体外的特殊DNA复制，通过温度变化控制DNA的变性和复性，加入设计引物、DNA聚合酶、dNTPs就可以完成特定基因的体外复制。PCR的最大特点就是较大的扩增能力和极高的灵敏度，这项技术广泛应用于生物学的各个方面。

发明内容

本发明的目的在于提供一种针对杧果细菌性角斑病菌的引物组，并采用聚合酶链式反应进行检测，具有操作简单、结果快捷准确、灵敏度高的特点。

本发明具体通过以下技术方案实现：

一种检测杧果细菌性角斑病菌的引物组，包括引物对XcmU1-FR、XcmU2-FR和XcmU3-FR，分别为：

正向引物：

XcmU1-F：5’-CCTCCGCAAAGGACCATGAGT-3’；

XcmU2-F：5’-ACCTCGTTGGCTTCAGAGTG-3’；

XcmU3-F：5’-GACTGTCGATGGAGGCGTAG-3’；

反向引物：

XcmU1-R：5’-GCTCTCCTCGAAGCCTTGATCG-3’；

XcmU2-R：5’-CGGTCTTGTCCCAGACAGTG-3’；

XcmU3-R：5’-ACAAACAGGGCAACGAAAGC-3’。

所述引物对XcmU1-FR、XcmU2-FR和XcmU3-FR的扩增产物大小分别为297bp、237bp和357bp。

在本发明的另一方面，提供了一种检测杧果细菌性角斑病菌的方法，包括以下步骤：

1)提取待检测样品的总DNA；

2)以待检测样品总DNA为模板，利用引物对XcmU1-FR、XcmU2-FR和XcmU3-FR分别进行PCR扩增；

3)扩增产物进行凝胶电泳，依据凝胶电泳结果进行判断：若能扩增出大小分别为297bp、237bp和357bp的产物中的任意一条或多条产物，则认为该样品中存在杧果细菌性角斑病菌。