[发明专利]与辣椒果实朝向紧密相关SNP的应用、其特异性CAPS引物及鉴定方法在审
| 申请号： | 202110617856.3 | 申请日： | 2021-06-01 |
| 公开（公告）号： | CN113355442A | 公开（公告）日： | 2021-09-07 |
| 发明（设计）人： | 王立浩;程锋;曹亚从;于海龙;张宝玺;张正海;张亢;陈姝敏;张伟丽;景雅欣 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京法信智言知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11737 | 代理人： | 尹超群 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 辣椒 果实 朝向 紧密 相关 snp 应用 特异性 caps 引物 鉴定 方法 | ||
1.与辣椒果实朝向紧密相关SNP用于鉴定辣椒果实朝向的应用，其特征在于，所述SNP位点的位置为Chr12：37458043，其中，野生型基因组碱基为C，其果实朝上；突变碱基为T，其果实朝下。
2.根据权利要求1所述的与辣椒果实朝向紧密相关SNP的应用，其特征在于，基于所述SNP位点设计特异性引物，并将PCR产物采用进行酶切，在Chr12：37458043位点处碱基为C时，能够被酶切开，则辣椒果实朝上，碱基为T时，不能被酶切开，则辣椒果实朝下。
3.与辣椒果实朝向紧密相关SNP的特异性CAPS引物，其特征在于，所述引物的核苷酸序列如下所示：
F-5’AGCTTATCACAACTCCGCACT3’；R-5’CCTGCACATCTGATCGCACTA3’。
4.权利要求3所述的与辣椒果实朝向紧密相关SNP的特异性CAPS引物的应用。
5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述特异性CAPS引物用于鉴定辣椒果实的朝向。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，将PCR产物采用MspI进行酶切，在Chr12：37458043位点处碱基为C时，能够被酶切开，则辣椒果实朝上，碱基为T时，不能被酶切开，则辣椒果实朝下。
7.鉴定辣椒果实朝向的方法，其特征在于，所述方法包括使用与辣椒果实朝向紧密相关SNP的特异性CAPS引物对待测材料进行PCR扩增的步骤，所述引物的核苷酸序列如下所示：
F-5’AGCTTATCACAACTCCGCACT3’；R-5’CCTGCACATCTGATCGCACTA3’。
8.根据权利要求7所述的鉴定辣椒果实朝向的方法，其特征在于，PCR产物的条带长度均为398bp，将PCR产物采用MspI进行酶切，在Chr12：37458043位点处碱基为C时，能够被酶切开，则辣椒果实朝上，碱基为T时，不能被酶切开，则辣椒果实朝下。
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