[发明专利]一种基于线性质粒载体从基因组文库中靶向克隆目标片段的方法有效
申请号: | 202110620674.1 | 申请日: | 2021-06-03 |
公开(公告)号: | CN113355338B | 公开(公告)日: | 2023-04-28 |
发明(设计)人: | 元英进;崔有志;李炳志;周见庭 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | C12N15/63 | 分类号: | C12N15/63;C12N15/10 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 潘颖 |
地址: | 300073 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 线性 质粒 载体 基因组 文库 靶向 克隆 目标 片段 方法 | ||
1.一种基于线性质粒载体从基因组文库中靶向克隆目标片段的方法,其特征在于,包括如下步骤:
在环形质粒上添加tos序列,所得带有tos的环形质粒在进行体外PCR扩增并使用TelN原端粒酶进行线性化的同时,在载体两端引入与目标基因组片段侧翼相同的序列,得到高浓度线性化克隆载体;
将线性化克隆载体与基因组文库进行体外组装,得到组装产物;
在宿主基因中整合入TelN蛋白表达基因盒,得到整合有TelN蛋白的宿主;
将组装产物转入整合有TelN蛋白的宿主中,筛选目标片段;
所述环形质粒为pBAC质粒;
所述tos序列的添加位点为incC元件和sopA元件之间;
所述宿主为大肠杆菌。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述与目标基因组片段侧翼相同的序列的大小为20~100bp。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因组文库选自但不限于大肠杆菌基因组文库、酿酒酵母基因组文库或者哺乳动物基因组文库。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因组文库的构建方法为:将基因组DNA采用限制性内切酶进行酶切,
或者,使用CRISPR/cas系统酶切基因组DNA。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述限制性内切酶选自但不限于NotI、SbfI、MluI。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述组装所用试剂为 HiFiDNAAssembly MasterMix或Gibson试剂。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其特征在于,所述在载体两端引入与目标基因组片段侧翼相同的序列的同时,还包括在线性化载体两侧添加酶切序列,构建高通量测序BAC文库的步骤。
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