[发明专利]与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记、检测引物、试剂盒及应用有效
申请号: | 202110624414.1 | 申请日: | 2021-06-04 |
公开(公告)号: | CN113151509B | 公开(公告)日: | 2023-09-05 |
发明(设计)人: | 韩瑞丽;唐贺贺;康相涛;李转见;黄河天;李文婷;蒋瑞瑞;李东华;李红;李国喜;田亚东;孙桂荣 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/42;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州睿信知识产权代理有限公司 41119 | 代理人: | 郭佳效 |
地址: | 450046 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 血清 碱性磷酸酶 水平 相关 分子 标记 检测 引物 试剂盒 应用 | ||
1.与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记包括SNP分子标记1、SNP分子标记2、SNP分子标记3和SNP分子标记4四个完全连锁的多态性分子标记,构成G-C-A-C和A-T-G-A两种单倍型;
所述SNP分子标记1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其5’端起第139位碱基,多态性为G或A;
所述SNP分子标记2的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其5’端起第201位碱基,多态性为C或T;
所述SNP分子标记3的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其5’端起第289位碱基,多态性为A或G;
所述SNP分子标记4的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其5’端起第315位碱基,多态性为C或A。
2.权利要求1所述的分子标记或其中的至少一个SNP分子标记的应用,所述应用为非疾病诊断目的,为以下任一所示:
1)在评价鸡血清碱性磷酸酶水平方面的应用;
2)在鸡血清碱性磷酸酶水平分子辅助选择育种方面的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,选择SNP分子标记1作为标签SNP分子标记,对SNP分子标记1的基因型进行检测,当待测鸡的基因型为GG时,待测鸡为低水平血清ALP个体,当待测鸡的基因型为AA时,待测鸡为高水平血清ALP个体。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,排除GG基因型的鸡个体。
5.用于检测权利要求1所述分子标记的基因型的引物的应用,所述应用为非疾病诊断目的,为以下任一所示,1)在评价鸡血清碱性磷酸酶水平方面的应用,2)在鸡血清碱性磷酸酶水平分子辅助选择育种方面的应用,其特征在于,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
6.用于检测权利要求1所述分子标记的基因型的试剂盒的应用,所述应用为非疾病诊断目的,为以下任一所示,1)在评价鸡血清碱性磷酸酶水平方面的应用,2)在鸡血清碱性磷酸酶水平分子辅助选择育种方面的应用,其特征在于,所述试剂盒包含核苷酸序列如SEQID NO:2和SEQ ID NO:3所示的引物,以及Hinfl内切酶。
7.评价鸡血清碱性磷酸酶水平的方法,所述方法为非疾病诊断目的,其特征在于,包括如下步骤:检测如权利要求1所述的分子标记或其中的至少一个SNP分子标记的基因型。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,采用核苷酸序列如SEQ ID NO:2和SEQ IDNO:3所示的引物,以待测鸡基因组DNA为模板进行PCR扩增,对PCR产物用Hinfl内切酶进行酶切,若酶切产物为589 bp,突变处碱基为纯合GG型,若酶切产物为451/138 bp,则突变处碱基为纯合AA型,若酶切产物为589/451/138 bp,则突变处碱基为杂合GA型;当待测鸡的基因型为GG时,待测鸡为低水平血清ALP个体,当待测鸡的基因型为AA时,待测鸡为高水平血清ALP个体。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,PCR的反应程序为:95℃ 5min;95℃ 15s,63℃ 15s,72℃ 10s,共35个循环;72℃ 5min。
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