[发明专利]与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记、检测引物、试剂盒及应用

说明书

本发明涉及与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记、检测引物、试剂盒及应用。本发明通过研究发现鸡ST3GAL4基因存在与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记，所述分子标记包括SNP位点1‑4(475471GA、475533CT、475621AG、475647CA)四个完全连锁的多态性位点，构成G‑C‑A‑C和A‑T‑G‑A两种单倍型，基因分型后关联分析发现与ALP高度相关。对本发明提供的分子标记或其中的至少一个SNP位点进行基因型检测，能够用于评价鸡血清ALP水平和鸡分子辅助选择育种，为鸡种质资源改良奠定了基础。试验证明，以SNP位点1(475471GA)作为标签SNP分子标记，对SNP位点1的基因型进行检测能准确评价鸡血清ALP水平：当待测鸡的基因型为GG时，待测鸡为低水平血清ALP个体，当待测鸡的基因型为AA时，待测鸡为高水平血清ALP个体。

技术领域

本发明属于生物育种技术领域，具体涉及与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记、检测引物、试剂盒及应用。

背景技术

血液生化指标对动物机体的正常生长发育至关重要，能够直接反应动物生理功能，有重要的指示作用。其中血清ALP(碱性磷酸酶)在骨骼生长发育过程中发挥着重要作用，主要由肝脏和成骨细胞分泌，能够反映骨代谢的活跃程度，参与骨骼钙化过程，而骨骼能够直接影响动物的经济性状。在机体快速生长发育期，ALP水平升高1-2倍。目前，关于ALP的研究主要集中在人类疾病上，临床上测定ALP主要用于骨骼、肝胆系统疾病的鉴别和诊断，在鸡上的相关研究较少。鸡的腿病严重影响了家禽业的健康发展，其中肢体内外翻畸形(VVD)是常发腿病之一，由基因型效应和环境效应的共同作用来调控。前期研究发现患VVD肉鸡血清中ALP显著低于腿部健康鸡，为了维护家禽肢体健康、减少家禽产业经济损失，借助快速、简便、有效的鸡血清ALP的分子遗传标记，可以应用于大群体的检测，加快VVD遗传改良和育种进程。

ST3GAL4在OA患者(Osteoarthritis，OA)的软骨组织中高度表达，能够介导软骨细胞外机制的降解、凋亡和增殖。此外，研究发现miR-193b与ST3GAL4具有靶标关系，且过表达ST3GAL4会影响CD44唾液酸化，降低其与润滑素的结合能力，介导NF-κB通路的活性。这些研究表明miR-193b/ST3GAL4轴通过NF-κB途径调节CD44唾液酸化，对OA的发生起着关键作用。在人类疾病的相关研究中发现，ST3GAL4的产物可以通过影响肝酶浓度，增加患肝硬化、II型糖尿病和心血管疾病的风险，且ST3GAL4基因上rs11220462处的SNP与胆固醇(T-CHO)和低密度脂蛋白(LDL-C)浓度显著相关。血液生化指标中血清ALP指标具有中高等遗传力。因此，了解ST3AL4基因遗传变异与ALP的关系可能会为众多与血液生化指标异常引起的相关疾病提供新见解。然而，关于ST3GAL4基因的研究目前主要集中在人上，在鸡上并未展开ST3GAL4基因多态性与ALP相关的研究。

发明内容

本发明的目的在于提供与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记，该分子标记包括SNP位点1、SNP位点2、SNP位点3和SNP位点4四个完全连锁的多态性位点。

本发明的第二个目的在于提供上述分子标记或其中的至少一个SNP位点的应用。

本发明的第三个目的在于提供用于检测上述分子标记的基因型的引物。

本发明的第四个目的在于提供用于检测上述分子标记的基因型的试剂盒。

本发明的第五个目的在于提供上述引物或试剂盒的应用。

本发明的第六个目的在于提供评价鸡血清碱性磷酸酶水平的方法。

为了实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

与鸡血清碱性磷酸酶水平相关的分子标记，所述分子标记包括SNP位点1、SNP位点2、SNP位点3和SNP位点4四个完全连锁的多态性位点，构成G-C-A-C和A-T-G-A两种单倍型；