[发明专利]蓝莓品种特异性分子标记位点及其筛选方法和应用在审
申请号: | 202110649995.4 | 申请日: | 2021-06-10 |
公开(公告)号: | CN113322341A | 公开(公告)日: | 2021-08-31 |
发明(设计)人: | 王晓菲;任志娜;庞薇;尼秀媚;段方猛;韩金宏;吕金浮 | 申请(专利权)人: | 山东大丰园农业有限公司;潍坊科技学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京知企鸿蒙专利代理事务所(普通合伙) 11692 | 代理人: | 刘帅帅 |
地址: | 262300 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蓝莓 品种 特异性 分子 标记 及其 筛选 方法 应用 | ||
1.能够准确鉴定37种蓝莓品种包括Berkeley、Biloxi、Bluecrop、Bluegold、Blueray、Brigitta、Earliblue、Elliott、Hardyblue、Jersey、Jubilee、Legacy、Misty、O'Neal、Patriot、Reka、Rubel、Sharpblue、Spartan、Summit、Sunshine Blue、Toro、Bluetta、PowderBlue、Pink Lemonade、Sweet Heart、JE、EM、Duke与C2--Duke(为不同来源Duke品种)、Draper、Liberty、US-R-03、US-S-08、US-S-09、L1、L3和普鲁的SNP位点,其特征在于,包括1412个位点,具体位点见表1。
2.利用简化基因组测序技术测序Super-GBS筛选蓝莓品种特异分子标记的方法,其特征在于,包括下列步骤:
(1)利用品种准确的37种蓝莓品种为样品,提取叶片基因组DNA;
(2)按照简化基因组测序技术Super-GBS方法构建文库,文库质检合格后上机测序;
Super-GBS测序文库构建接头及引物序列如下表2
名称 序列(5’-3’) Common adaptor top GATCGGTCTCGGCATTCCTGCTGAACCGCTCTTCCGATCT Common adaptor bot CGAGATCGGAAGAGCGGGGACTTTAAGC PstI adaptor top CACGACGCTCTTCCGATCTAACXXXXXXTGCA PstI adaptor bot YYYYYYAGATCGGAAGAGCGTCGTG Primer1 AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT Primer2 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGGTCTCGGCATTCCTGCTGAA
(3)根据每个品种的分型结果,首先剔除所有样品中分型一致的位点,然后筛选每个品种内所有个体分型完全一致、且没有个体缺失的位点,获得SNP位点,利用37种蓝莓品种的标准样品对获得的SNP位点进行过滤筛选,并利用37种蓝莓品种的盲样进行SNP位点的验证,最终获得能够准确鉴定37种蓝莓品种的SNP位点(见表1)。
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