[发明专利]基于纳米孔测序平台的组织样本宏基因组建库和检测方法有效
申请号: | 202110650442.0 | 申请日: | 2021-06-10 |
公开(公告)号: | CN113249440B | 公开(公告)日: | 2022-03-22 |
发明(设计)人: | 周水莲;程彪;潘吾思;赵成娜;户银芝;李诗濛;任用 | 申请(专利权)人: | 南京先声医学检验实验室有限公司;北京先声医学检验实验室有限公司;江苏先声诊断技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C40B50/06 |
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地址: | 210042 江苏省南*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 纳米 孔测序 平台 组织 样本 宏基 组建 检测 方法 | ||
1.一种用于纳米孔测序平台的组织样本宏基因组建库的组织样本处理方法,其特征在于,所述方法包括:
步骤1)组织样本破碎;所述破碎采用MP的Lysing Matrix A管进行破碎;
步骤2)组织样本病原体破壁;所述组织样本病原体破壁采用Proteinase K消化后再加入Lysing Matrix E管处理;
所述步骤1)组织样本破碎具体步骤为:取组织样本和PBS加至Lysing Matrix A管;6-8m/s震荡30-40s,运行1-3次,离心处理;
所述步骤2)组织样本病原体破壁具体步骤为:向沉淀样本中加入裂解液和ProteinaseK;震荡孵育后转移至Lysing Matrix E管;6-8m/s,30-40s 运行1-3次;离心转移备用。
2.权利要求1所述的组织样本处理方法,其特征在于,所述步骤1)中的震荡为6m/s震荡40s,设置1次。
3.权利要求1-2任一所述的组织样本处理方法,其特征在于,所述步骤2)中;所述Proteinase K为Oryzogen的Proteinase K; 所述震荡孵育后转移至Lysing Matrix E管;6m/s,40s 运行1次。
4.权利要求1-3任一所述组织样本处理方法,其特征在于,步骤2)样本病原体破壁前进一步包括组织样本的去宿主步骤;所述去宿主采用常规去宿主试剂盒进行宿主去除。
5.一种组织样本宏基因组核酸提取方法,其特征在于,所述方法包括权利要求1-4任一所述组织样本处理方法,并进一步包括常规核酸提取步骤。
6.一种组织样本宏基因组建库方法,其特征在于,所述方法包括权利要求5所述组织样本宏基因组核酸提取方法,并进一步包括基于提取核酸进行常规建库步骤。
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