[发明专利]一种基于单核细胞采集肿瘤核酸的胶质瘤分检装置在审
申请号: | 202110660861.2 | 申请日: | 2021-06-15 |
公开(公告)号: | CN113393901A | 公开(公告)日: | 2021-09-14 |
发明(设计)人: | 汪强虎;吴维;吴玲祥;王子宇 | 申请(专利权)人: | 南京医科大学 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B35/20;G16B40/00;G16B50/00 |
代理公司: | 北京汇捷知识产权代理事务所(普通合伙) 11531 | 代理人: | 赵艳 |
地址: | 210000 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 单核 细胞 采集 肿瘤 核酸 胶质 瘤分检 装置 | ||
本发明公开了一种基于单核细胞采集肿瘤核酸的胶质瘤分检装置,该装置包括:采集模块,用于采集单核细胞内的肿瘤核酸;信息对比模块,用于对高通量测序的下机数据进行处理,并将下机数据比对至参考基因组,获得表达信息;信息分析模块,用于将基因组合中的基因的表达进行统计,计算胶质瘤特征基因得分;判定模块,用于依据计算胶质瘤特征基因得分预测待测样本的胶质瘤状态。本发明装置可用于肿瘤早期的确诊分析,早发现早治疗,以提高治疗的有效性,避免其进展到晚期后治疗无效。
技术领域
本发明属于医疗装置领域,尤其涉及一种基于单核细胞采集肿瘤核酸的胶质瘤分检装置。
背景技术
现有分检装置包括各类影像学检查,主要包括核磁共振成像(magneticresonance imaging,MRI)、X线电子计算机断层成像(Computed Tomography,CT)、单光子发射计算机断层成像术(Single-Photon Emission Computed Tomography,SPECT)和正电子发射断层扫(Positron Emission Tomography-Computed Tomography,PET-CT)等。常规影像学方法缺陷在于难以发现直径小于1cm的微小病灶。此外,分子影像技术通过肿瘤分子标记探针,利用MRI等成像手段可以在无创早期中及时发现肿瘤细胞信号。然而其特异性的分子探针设计较为复杂(例如需设计可代谢的无毒副作用的分子探针;针对不同成像工具设计特异检测探针等),限制了分子影像技术的使用。
目前,基于血液的分检装置主要是检测血液中的循环肿瘤细胞(circulatingtumor cells,CTC)、循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)、外泌体(exosome)和肿瘤驯化的血小板(tumor educated platelet,TEP)等。然而,CTC和ctDNA在胶质瘤患者外周血中极其微量。例如,Muller等人研究发现,141例胶质瘤患者的外周血中仅有20%的患者能够检测到CTC,且其中部分患者10ml外周血中仅能发现一个CTC;另外,研究发现10ml血浆中能检测到携带突变的ctDNA不足10条。
因此,亟待寻找新的胶质瘤特异性标记,开发新的早期检测和术后监测方法。研究发现,髓系单核细胞浸润发生在肿瘤形成早期,且与正常人相比,胶质瘤患者外周血中的单核细胞显著增多,肿瘤级别越高,单核细胞数量越多。上述研究表明,骨髓来源的单核细胞浸润发生在在肿瘤形成早期且伴随肿瘤进全过程,因此,外周血中的单核细胞可以作为预测是否存在胶质瘤以及胶质瘤进展的胶质瘤早期筛查及进展监测的指标。
发明内容
本发明的目的在于提供一种基于单核细胞采集肿瘤核酸的胶质瘤分检装置,旨在解决现有胶质瘤特异性标记的早期检测和术后监测方法所存在的各种不足之处。
本发明是这样实现的,一种基于单核细胞采集肿瘤核酸的胶质瘤分检装置,该装置包括:
采集模块,用于采集单核细胞内的肿瘤核酸;
信息对比模块,用于对高通量测序的下机数据进行处理,并将下机数据比对至参考基因组,获得表达信息;
信息分析模块,用于将基因组合中的基因的表达进行统计,计算胶质瘤特征基因得分;
判定模块,用于依据计算胶质瘤特征基因得分预测待测样本的胶质瘤状态。
优选地,在采集模块中,所述的采集单核细胞内的肿瘤核酸具体为:从外周血分离出CD14+单核细胞。
优选地,在信息对比模块中,所述下机数据进行处理具体包括:对测序所得的每个样本序列进行过滤以去除掉不合格的序列和接头序列。
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