[发明专利]一组用于鉴定山桃杂交群体抗/感桃蚜性状的InDel标记及其应用在审
| 申请号： | 202110680930.6 | 申请日： | 2021-06-18 |
| 公开（公告）号： | CN113186339A | 公开（公告）日： | 2021-07-30 |
| 发明（设计）人： | 王力荣;王君秀;李勇;王新卫;朱更瑞;曹珂;吴金龙;陈昌文;方伟超 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 郑州中鼎万策专利代理事务所(普通合伙) 41179 | 代理人： | 林新园 |
| 地址： | 450004 河南*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一组 用于 鉴定 山桃 杂交 群体 感桃蚜 性状 indel 标记 及其 应用 | ||
1.一组用于鉴定山桃杂交群体抗/感桃蚜性状的InDel标记，其特征在于，所述InDel标记包括InDel-1标记和InDel-2标记，其中，InDel-1标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，InDel-2标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.一种扩增如权利要求1所述InDel标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括InDel-1引物对和InDel-2引物对，两组引物对的上下游引物均是根据插入缺失位点的上下游序列进行设计。
3.根据权利要求2所述的引物对，其特征在于，所述InDel-1引物对的F端引物序列如SEQ ID NO.3所示，R端引物序列如SEQ ID NO.4所示；
所述InDel-2引物对的F端引物序列如SEQ ID NO.5所示，R端引物序列如SEQ ID NO.6所示。
4.一种如权利要求1所述InDel标记在山桃杂交群体抗/感桃蚜性状分子标记辅助选择育种方面的应用。
5.一种利用权利要求1所述InDel标记鉴定山桃杂交群体抗/感桃蚜性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)提取DNA：采集待测山桃的叶片，提取基因组DNA，作为PCR扩增的模板；
(2)PCR扩增：以上述提取的DNA为模板，分别用权利要求2或3所述的InDel-1引物对和InDel-2引物对进行PCR扩增，以获得相应的PCR扩增产物；
(3)基因型鉴定：对InDel-1引物对扩增所得的PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测，对InDel-2引物对扩增所得的PCR扩增产物进行测序，根据检测结果预测山桃抗/感桃蚜性状。
6.根据权利要求5所述的利用InDel标记鉴定山桃杂交群体抗/感桃蚜性状的方法，其特征在于，
当InDel-1引物对扩增所得的PCR扩增产物含有89bp的DNA片段，或者InDel-2引物对扩增所得的PCR扩增产物在对应于Lovell基因组组装的Scaffold 3的第24761660碱基处为A时，则待测山桃为山桃杂交群体中抗桃蚜材料；
当InDel-1引物对扩增所得的PCR扩增产物仅有一条113bp的DNA片段，并且InDel-2引物对扩增所得的PCR扩增产物在对应于Lovell基因组组装的Scaffold 3的第24761660碱基处为TTTCCGGCC时，则待测山桃为山桃杂交群体中感桃蚜材料。
7.一种用于鉴定山桃杂交群体抗/感桃蚜性状的试剂盒，其特征在于，包括权利要求2或3所述的引物对。
8.一种如权利要求7所述试剂盒在山桃杂交群体抗/感桃蚜性状分子标记辅助选择育种方面的应用。
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